內容大鋼
本書共分八章，主要介紹了大豆胞囊線蟲病概述、病原線蟲生物學特性、病害發生流行規律、大豆種質資源抗病性鑒定評價、大豆抗胞囊線蟲病生理生化響應、基於GWAS與BSA的抗性遺傳解析、轉錄組視角下的抗性分子機制、抗病候選基因挖掘與功能驗證、抗病育種技術及應用等核心內容。
作者介紹
編者:伊六喜//胡海波//孫賓成//史樹德|責編:王陳路
目錄
前言
第一章 導論
第一節 大豆胞囊線蟲概況
一、大豆胞囊線蟲的生活史
二、大豆胞囊線蟲病的傳播及危害
三、大豆胞囊線蟲病對大豆產業的影響
第二節 大豆胞囊線蟲的發病規律與防治措施
一、發病規律
二、防治措施
第三節 大豆抗胞囊線蟲病的研究進展
一、大豆胞囊線蟲病資源鑒定與抗線蟲品種應用
二、大豆胞囊線蟲病對植物生理指標的影響
三、大豆胞囊線蟲病的組學研究
第二章 不同大豆資源對大豆胞囊線蟲病的抗性鑒定
第一節 材料與方法
一、材料來源
二、大豆胞囊線蟲病病圃鑒定
三、室內考種
四、品質測定
第二節 結果
一、參試材料的抗病性鑒定
二、主要農藝性狀分析
三、參試材料在不同環境下的農藝性狀變異性分析
四、參試材料的聚類分析
五、大豆胞囊線蟲雌蟲指數與表型性狀的相關性分析
六、籽粒性狀與大豆胞囊線蟲FI的遺傳相關性分析
七、參試材料農藝性狀的綜合評價
第三節 討論與小結
一、討論
二、小結
第三章 大豆胞囊線蟲脅迫對不同大豆資源生化?的影響
第一節 材料與方法
一、大豆胞囊線蟲來源
二、實驗主要儀器和材料
三、盆栽人工接種鑒定
四、葉綠素含量以及根組織?活的測定
第二節 結果
一、表型性狀測定結果分析
二、參試材料在人工接種環境下的表型性狀變異性分析
三、參試材料的抗病性鑒定
四、大豆胞囊線蟲抗病性鑒定與表型性狀的相關性
五、大豆胞囊線蟲對大豆植株葉綠素含量的影響
六、大豆胞囊線蟲對大豆根部丙二醛含量的影響
七、不同抗性品種接種SCN3後過氧化物?活性的變化
八、不同抗性品種接種SCN3后苯丙氨酸解氨?活性的變化
第三節 討論與小結
一、討論
二、小結
第四章 基於全基因組關聯分析技術挖掘大豆胞囊線蟲抗性基因
第一節 材料與方法
一、植物材料
二、試驗設計
三、大豆基因組DNA提取
四、文庫構建與高通量測序
五、SNP檢測和連鎖不平衡分析
六、群體結構分析
七、全基因組關聯分析
第二節 結果
一、測序數據質控
二、參考基因組比對
三、插入片段分佈統計
四、深度分佈統計
五、群體結構分析
六、大豆胞囊線蟲病抗性全基因組關聯分析
七、GWAS關聯位點基因GO富集分析
八、GWAS關聯位點基因KEGG富集分析
第三節 討論與小結
一、簡化基因組測序
二、全基因組關聯分析
三、小結
第五章 基於集團分離法挖掘大豆胞囊線蟲病抗性基因
第一節 材料和方法
一、植物材料
二、大豆胞囊線蟲病抗性鑒定
三、基因組DNA分離
四、DNA文庫構建
五、測序數據分析
六、候選基因的定位及分析
七、RT-qPCR檢測
第二節 結果
一、大豆胞囊線蟲病的抗性鑒定
二、測序質量評估
三、SNP檢測和註釋
四、BSA關聯基因GO分析
五、BSA關聯基因代謝分析
六、BSA關聯基因KEGG分析
七、候選基因篩選
八、RT-qPCR檢測
第三節 討論與小結
一、討論
二、小結
第六章 大豆胞囊線蟲病抗性轉錄組分析
第一節 材料與方法
一、試驗大豆品種
二、接種SCN3
三、生理生化指標的測定
四、大豆根系RNA提取及文庫構建
五、數據質控及序列分析
六、拼接與功能註釋
七、WGCNA分析
八、RT-qPCR驗證
第二節 結果
一、大豆胞囊線蟲脅迫下生理生化指標的差異
二、測序數據初步分析
三、SNP分析
四、差異表達基因分析
五、差異表達基因GO註釋分析
六、差異基因KEGG分析
七、抗感材料在同一取樣時間的GO分析
八、抗感材料在同一取樣時間的KEGG分析
九、轉錄因子分析
十、抗病性模塊的WGCNA
十一、兩個模塊的基因分析
十二、RT-qPCR驗證
第三節 討論與小結
一、大豆胞囊線蟲脅迫引起差異基因表達
二、與大豆胞囊線蟲抗性相關的主要生物學過程
三、與大豆胞囊線蟲抗性相關的主要KEGG通路
四、小結
第七章 多基因組技術聯合分析定位大豆胞囊線蟲病抗性基因
第一節 不同基因組技術定位結果分析
一、BSA和GWAS聯合分析
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