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單細胞測序技術及其醫學應用/雙一流大學醫工結合系列著作

  • 作者：編者:王廷華//熊柳林|責編:胡曉燕|總主編:王廷華
  • 出版社：四川大學
  • ISBN：9787569084276
  • 出版日期：2026/03/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：233
人民幣：RMB 58 元      售價：元
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內容大鋼
    單細胞測序技術根據同類細胞表達相同基因，不同細胞表達差異基因的原理，通過基因標識來區分、聚類各自細胞類型，進行細胞分群，對了解組織細胞發育類型、衰老軌跡變化及損傷修復變化，和疾病狀態細胞亞群、細胞通信變化，有重要科學價值和現實意義。單細胞測序技術突破簡單化碎片化研究從系統的角度解析生物體發育變化特徵，發現疾病變化差異細胞群，揭示細胞基因網路關係，是大數據領域核心關鍵技術之一。本書在介紹單細胞測序技術發展及原理的基礎上，重點介紹了單細胞測序技術實驗設計、操作流程、數據分析核心方法，並用案例展示的形式介紹單細胞測序技術在腫瘤、神經、糖尿病等中的應用，為從事單細胞測序技術的實驗人員、數據分析人員、生物科學和臨床醫務工作者、及相關專業的本科生、研究生學習提供參考、指導。是一本知識系統全面、技術完善、實用性較強的領域內有較高學術價值和使用價值的參考用的書
作者介紹
編者:王廷華//熊柳林|責編:胡曉燕|總主編:王廷華
目錄
上篇：單細胞轉錄組測序數據分析流程介紹
第一章  Cell Ranger軟體下載安裝
第二章  Cell Ranger軟體對應庫文件的下載
第三章  Cell Ranger軟體count定量
第四章  Seurat單細胞數據分析標準流程
  第一節  Seurat包安裝與導入
  第二節  數據讀取
  第三節  創建Seurat對象
  第四節  過濾線粒體基因和低質量細胞
  第五節  數據標準化
  第六節  尋找高變基因
  第七節  數據縮放
  第八節  數據降維
  第九節  細胞聚類
第五章  差異marker基因分析
第六章  細胞類型鑒定和註釋
  第一節  SingleR自動細胞類型註釋R軟體包
  第二節  細胞類型手動註釋
  第三節  Monocle單細胞擬時序分析
第七章  細胞通訊分析
  第一節  CellChat的下載和安裝
  第二節  數據讀取和創建CellChat對象
  第三節  添加必要信息到metadata中
  第四節  導入配受體庫
  第五節  數據預處理
  第六節  推斷細胞間相互作用網路分析
  第七節  細胞通訊結果可視化
  第八節  不同分組之間的細胞通訊配對分析
第八章  轉錄因子預測分析
  第一節  SCENIC的下載與安裝
  第二節  數據輸入與初始設置
  第三節  共表達網路計算
  第四節  構建並評分GRN
  第五節  篩選和可視化細胞類型或細胞群的轉錄因子
第九章  雙胞鑒定
第十章  多樣本整合與去批次效應
總結
下篇：單細胞轉錄組測序數據分析實戰案例
第十一章  小鼠疼痛單細胞數據分析案例
  第一節  分析方法
  第二節  結果
第十二章  單細胞測序技術在心肌缺血中的應用進展
  第一節  心肌缺血簡介
  第二節  單細胞測序技術簡介
  第三節  心肌缺血的檢測與治療現狀
  第四節  單細胞測序技術原理、操作流程及心肌缺血研究應用進展
  第五節  當前挑戰和技術瓶頸
  第六節  總結和展望
參考文獻

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