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腸球菌比較基因組學

  • 作者：鍾智|責編:鄭彩娟
  • 出版社：輕工
  • ISBN：9787518453955
  • 出版日期：2026/03/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：202
人民幣：RMB 88 元      售價：元
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內容大鋼
    作為一種重要的乳酸菌，腸球菌在發酵食品中的使用比較廣泛。然而，由於部分腸球菌還是條件致病菌，所以其安全性並沒有得到公認，這對腸球菌在食品工業中的使用造成了很大的限制。本書基於比較基因組學技術系統分析了腸球菌屬以及腸球菌屬重要的物種屎腸球
    菌、糞腸球菌和乳酸腸球菌食品分離株的基因組特徵，包括菌株遺傳進化、環境適應性、耐葯基因和毒力因子等，為腸球菌的安全性評價奠定了基礎。本書可以作為腸球菌和比較基因組研究的參考書。
作者介紹
鍾智|責編:鄭彩娟
目錄
緒論
    參考文獻
第一章 腸球菌屬的比較基因組分析
  第一節 腸球菌屬的一般基因組特徵
  第二節 腸球菌屬的系統發育和進化
  第三節 腸球菌屬的碳水化合物代謝
  第四節 腸球菌屬的抗生素耐藥性
    參考文獻
第二章 糞腸球菌的比較基因組分析
  第一節 糞腸球菌
    一、糞腸球菌簡介
    二、細菌的耐葯基因、毒力因子和前噬菌體序列
    三、比較基因組學在腸球菌研究中的應用
  第二節 糞腸球菌的比較基因組分析: 對其環境適應性的見解
    一、糞腸球菌的一般基因組特徵
    二、糞腸球菌的泛基因組和核心基因組
    三、糞腸球菌的系統發育分析
    四、糞腸球菌的環境特異性基因
    五、糞腸球菌的耐葯基因
    六、糞腸球菌的毒力因子
    七、糞腸球菌的前噬菌體序列
  第三節 不同分離源糞腸球菌的毒力因子比較
    一、糞腸球菌毒力因子的鑒定
    二、毒力因子拷貝數分析
    三、毒力因子在基因組中的分佈情況
    四、糞腸球菌共有的毒力因子分析
    五、不同分離源糞腸球菌所含毒力因子
    六、環境特異性毒力因子
  第四節 基於全基因組關聯分析研究糞腸球菌發酵食品分離株的耐藥性
    一、糞腸球菌耐藥性結果
    二、與耐藥性相關的基因
    三、基因SecG的缺失與菌株的耐藥性
  第五節 基於比較基因組學技術研究糞腸球菌乳源分離株的安全性
    一、糞腸球菌基因組信息
    二、糞腸球菌平均核?酸一致性分析
    三、糞腸球菌核心基因集和泛基因集
    四、糞腸球菌系統發育樹的構建
    五、糞腸球菌的耐葯基因
    六、糞腸球菌的毒力因子的編碼基因
    七、可移動遺傳元件
    參考文獻
第三章 屎腸球菌的比較基因組分析
  第一節 屎腸球菌
  第二節 比較基因組學分析揭示屎腸球菌基因組的可塑性和環境適應性
    一、屎腸球菌基因組的一般特徵
    二、屎腸球菌的泛基因組和核心基因組
    三、屎腸球菌的系統發育分析
    四、屎腸球菌的耐葯基因
    五、屎腸球菌的毒力因子
    六、屎腸球菌的環境特異性基因

  第三節屎腸球菌乳源分離株抗生素耐藥性的全基因組關聯研究
    一、屎腸球菌乳源分離株的耐葯表型
    二、屎腸球菌的一般基因組特徵
    三、屎腸球菌的ANI分析
    四、屎腸球菌的核心基因和泛基因
    五、屎腸球菌的系統發育分析
    六、屎腸球菌毒力因子分析
    七、屎腸球菌耐葯基因分析
    八、全基因組關聯分析鑒定潛在的耐葯基因
    參考文獻
第四章 乳酸腸球菌的比較基因組分析
  第一節 乳酸腸球菌
    一、乳酸腸球菌簡介
    二、乳酸腸球菌的致病性因素
    三、全基因組關聯分析
  第二節 乳酸腸球菌乳源分離株的耐葯表型
  第三節 乳酸腸球菌的一般基因組特徵、 泛-核基因組
    及系統發育樹的構建
    一、一般基因組特徵
    二、核心基因組和泛基因組
    三、乳酸腸球菌系統發育樹的構建
  第四節 乳酸腸球菌基因組中的毒力因子
  第五節 乳酸腸球菌基因組中的耐葯基因及GWAS分析鑒定潛在的耐葯基因
    一、乳酸腸球菌的耐葯基因
    二、利用GWAS分析鑒定潛在耐葯表型編碼基因
    參考文獻
附錄
    附表1 糞腸球菌環境特異性基因列表
    附表2 糞腸球菌耐葯基因列表
    附表3 完整前噬菌體區在糞腸球菌菌株中的分佈
    附表4 通過Scoary鑒定出潛在的抗生素抗性基因
    附表5 乳酸腸球菌對15種抗生素的MIC分佈結果
    附表6 通過Scoary分析在60株乳酸腸球菌中鑒定出潛在的抗生素抗性基因

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