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腸球菌比較基因組學

  • 作者：鍾智|責編:鄭彩娟
  • 出版社：輕工
  • ISBN：9787518453955
  • 出版日期：2026/03/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：202
人民幣：RMB 88 元      售價：元
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內容大鋼
    本書總結了作者近十年來在腸球菌比較基因組學方面的研究成果，對腸球菌屬以及腸球菌屬的模式物種糞腸球菌、屎腸球菌和乳酸腸球菌的比較基因組學研究進行了系統地梳理，全面分析了腸球菌的遺傳與進化歷程。研究通過分析腸球菌基因組中攜帶的環境特異性基因、耐葯基因、毒力因子、前噬菌體序列和可移動遺傳元件等，發現腸球菌基因組具有較高的可塑性，解析了腸球菌的環境適應性機制。同時，採用全基因組關聯分析技術，結合腸球菌基因型和耐葯表型等基礎數據，發現了腸球菌潛在的耐葯基因，不僅為解析腸球菌的耐葯機制提供了基礎數據，也為腸球菌的安全性評估提供了參考。
    本書契合當下微生物研究前沿，為比較基因組學技術在微生物研究中的應用提供了參考。
作者介紹
鍾智|責編:鄭彩娟
    鍾智，博士，研究員，博士研究生導師。就職于內蒙古農業大學食品科學與工程學院乳品生物技術與工程教育部重點實驗室，主要從事乳酸菌資源開發與利用方面的研究工作。主持國家級和省部級科研項目10項。以第一作者和通訊作者發表學術論文30余篇；授權發明專利10項；參編教材1部；獲得內蒙古自治區科技進步獎一等獎、內蒙古自治區自然科學獎二等獎等科技獎勵。兼任中國微生物學會益生菌專業委員會委員、內蒙古自治區食品安全委員會委員、內蒙古自治區營養學會倫理委員會委員、Food Science and Animal Products期刊編委。
目錄
緒論
  參考文獻
第一章  腸球菌屬的比較基因組分析
  第一節  腸球菌屬的一般基因組特徵
  第二節  腸球菌屬的系統發育和進化
  第三節  腸球菌屬的碳水化合物代謝
  第四節  腸球菌屬的抗生素耐藥性
  參考文獻
第二章  糞腸球菌的比較基因組分析
  第一節  糞腸球菌
    一、糞腸球菌簡介
    二、細菌的耐葯基因、毒力因子和前噬菌體序列
    三、比較基因組學在腸球菌研究中的應用
  第二節  糞腸球菌的比較基因組分析:對其環境適應性的見解
    一、糞腸球菌的一般基因組特徵
    二、糞腸球菌的泛基因組和核心基因組
    三、糞腸球菌的系統發育分析
    四、糞腸球菌的環境特異性基因
    五、糞腸球菌的耐葯基因
    六、糞腸球菌的毒力因子
    七、糞腸球菌的前噬菌體序列
  第三節  不同分離源糞腸球菌的毒力因子比較
    一、糞腸球菌毒力因子的鑒定
    二、毒力因子拷貝數分析
    三、毒力因子在基因組中的分佈情況
    四、糞腸球菌共有的毒力因子分析
    五、不同分離源糞腸球菌所含毒力因子
    六、環境特異性毒力因子
  第四節  基於全基因組關聯分析研究糞腸球菌發酵食品分離株的耐藥性
    一、糞腸球菌耐藥性結果
    二、與耐藥性相關的基因
    三、基因SecG的缺失與菌株的耐藥性
  第五節  基於比較基因組學技術研究糞腸球菌乳源分離株的安全性
    一、糞腸球菌基因組信息
    二、糞腸球菌平均核?酸一致性分析
    三、糞腸球菌核心基因集和泛基因集
    四、糞腸球菌系統發育樹的構建
    五、糞腸球菌的耐葯基因
    六、糞腸球菌的毒力因子的編碼基因
    七、可移動遺傳元件
  參考文獻
第三章  屎腸球菌的比較基因組分析
  第一節  屎腸球菌
  第二節  比較基因組學分析揭示屎腸球菌基因組的可塑性和環境適應性
    一、屎腸球菌基因組的一般特徵
    二、屎腸球菌的泛基因組和核心基因組
    三、屎腸球菌的系統發育分析
    四、屎腸球菌的耐葯基因
    五、屎腸球菌的毒力因子
    六、屎腸球菌的環境特異性基因

  第三節  屎腸球菌乳源分離株抗生素耐藥性的全基因組關聯研究
    一、屎腸球菌乳源分離株的耐葯表型
    二、屎腸球菌的一般基因組特徵
    三、屎腸球菌的ANI分析
    四、屎腸球菌的核心基因和泛基因
    五、屎腸球菌的系統發育分析
    六、屎腸球菌毒力因子分析
    七、屎腸球菌耐葯基因分析
    八、全基因組關聯分析鑒定潛在的耐葯基因
  參考文獻
第四章  乳酸腸球菌的比較基因組分析
  第一節  乳酸腸球菌
    一、乳酸腸球菌簡介
    二、乳酸腸球菌的致病性因素
    三、全基因組關聯分析
  第二節  乳酸腸球菌乳源分離株的耐葯表型
  第三節  乳酸腸球菌的一般基因組特徵、泛-核基因組及系統發育樹的構建
    一、一般基因組特徵
    二、核心基因組和泛基因組
    三、乳酸腸球菌系統發育樹的構建
  第四節  乳酸腸球菌基因組中的毒力因子
  第五節  乳酸腸球菌基因組中的耐葯基因及GWAS分析鑒定潛在的耐葯基因
    一、乳酸腸球菌的耐葯基因
    二、利用GWAS分析鑒定潛在耐葯表型編碼基因
  參考文獻
附錄
  附表1  糞腸球菌環境特異性基因列表
  附表2  糞腸球菌耐葯基因列表
  附表3  完整前噬菌體區在糞腸球菌菌株中的分佈
  附表4  通過Scoary鑒定出潛在的抗生素抗性基因
  附表5  乳酸腸球菌對15種抗生素的MIC分佈結果
  附表6  通過Scoary分析在60株乳酸腸球菌中鑒定出潛在的抗生素抗性基因

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