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電腦輔助藥物設計實驗教程(第2版)

  • 作者：編者:李哲//羅海彬|責編:羅永梅
  • 出版社：中山大學
  • ISBN：9787306086204
  • 出版日期：2026/01/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：201
人民幣：RMB 88 元      售價：元
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內容大鋼
    本教材主要面向藥學專業高年級本科生和研究生，通過本課程的學習，讀者可對當前藥物研究中常見的藥物設計方法和常用電腦模擬軟體有初步的了解。當前藥學研究，特別是藥物化學研究中，常常需要計算數據的輔助支撐。本教材在編寫過程中，以電腦輔助藥物設計中常見的計算方法為主線，通過大量的上機實驗，使讀者對電腦輔助藥物設計有更加直觀的認識和更加深刻的理解，為讀者的進一步學習打下良好的基礎。
    本教材實例豐富、圖文並茂、可讀性強，在編寫過程中，編者力求軟體操作步驟詳盡清晰，方便高校教師教學和學生自主學習。
作者介紹
編者:李哲//羅海彬|責編:羅永梅
目錄
第一章 定量構效關係
  一、實驗目的
  二、實驗要求
  三、實驗原理
  四、實驗內容
    （一）背景介紹
    （二）實驗操作
  參考文獻
第二章 藥效團模型
  一、實驗目的
  二、實驗要求
  三、實驗原理
    （一）藥效團特徵的種類
    （二）藥效團模型的構建
    （三）基於藥效團模型藥物設計方法的應用
  四、實驗內容
    （一）背景介紹
    （二）實驗操作
  參考文獻
第三章 結構優化
  一、實驗目的
  二、實驗要求
  三、實驗原理
  四、實驗內容
    （一）構建化合物並優化結構（HyperChem）
    （二）保證水分子的C2v點群
    （三）保證鍺分子的Oh對稱性計算
    （四）同分異構體的單點能計算
    （五）靜電勢計算
    （六）觀察分子振動
    （七）預測紅外和拉曼光譜
  參考文獻
第四章 分子對接
  一、實驗目的
  二、實驗要求
  三、實驗原理
  四、實驗內容
    （一）LibDock對接方法及蛋白-配體相互作用的打分評價
    （二）CDOCKER和對接姿態分析
    （三）SYBYL軟體的分子對接模塊Surflex-Dock
    （四）MOE軟體的分子對接模塊Dock
    （五）總結
  參考文獻
第五章 分子動力學模擬
  一、實驗目的
  二、實驗要求
  三、實驗原理
  四、實驗內容
    （一）普瑞巴林的溶劑化模型及分子動力學模擬
    （二）MDM2抑製劑複合物的分子動力學模擬

  參考文獻
第六章 RDKit使用基礎及分子性質過濾的應用
  一、實驗目的
  二、實驗要求
  三、實驗原理
  四、實驗內容
    （一）Anaconda安裝與環境配置
    （二）Jupyter Notebook的使用
    （三）關鍵Python函數
    （四）RDKit使用基礎
    （五）RDKit應用案例——分子性質過濾
  參考文獻
第七章 人工智慧藥物發現初探
  一、實驗目的
  二、實驗要求
  三、實驗原理
  四、實驗內容
    （一）RDKit使用基礎
    （二）分子描述符計算
    （三）定量構效關係研究
  參考文獻

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