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水稻耐熱基因的挖掘及應用

  • 作者：駱鷹//汪啟明//饒力群|責編:郭銀巧//張利
  • 出版社：中國農業
  • ISBN：9787109330665
  • 出版日期：2025/02/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：145
人民幣：RMB 80 元      售價：元
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內容大鋼
    《水稻耐熱基因的挖掘及其應用》主要運用分子生物學、生物信息學方法闡述水稻耐熱基因研究的實驗過程與結果。該書共7章，第1章概述了高溫脅迫對水稻的危害作用、植物響應高溫脅迫的調控機理；第2章介紹了水稻應答高溫脅迫相關miRNAs及其靶基因的鑒定、表達驗證，詮釋了水稻秈、粳兩個亞種小RNA測序的分析結果；第3章從創建MiR398前體過表達載體、STTM398突變體入手，論述了水稻miR398響應高溫脅迫的表型、生理生化及表達功能；第4章論述了利用分子生物學技術驗證水稻miR398及其靶基因的作用機制；第5章、第6章主要利用生物信息學方法分別從水稻HSP40、GATA基因家族中挖掘耐熱基因；第7章從突變體表型、基因表達、生理變化等方面探討水稻OsBBX22基因的耐熱性功能。
    《水稻耐熱基因的挖掘及其應用》可供生物學、遺傳學、農學、生物工程和生物信息學等專業的教師、學生及相關領域的科研工作者參考使用。
作者介紹
駱鷹//汪啟明//饒力群|責編:郭銀巧//張利
目錄
序
前言
第1章  緒論
  1.1  高溫脅迫對水稻的危害
  1.2  植物對高溫脅迫的響應與調控
    1.2.1  植物對高溫脅迫信號的感知及轉導
    1.2.2  植物響應高溫脅迫的熱激轉錄因子調控
    1.2.3  植物響應高溫脅迫的miRNAs調控
  1.3  水稻應答高溫熱害相關基因的鑒定
  參考文獻
第2章  水稻孕穗期高溫脅迫應答相關miRNAs及其靶基因的鑒定與分析
  2.1  試驗材料
    2.1.1  選用的試驗材料
    2.1.2  所需主要儀器和試劑
    2.1.3  所用資料庫及分析軟體
  2.2  試驗方法
    2.2.1  小RNA文庫的構建和測序
    2.2.2  小RNA測序數據的分析
    2.2.3  篩選差異表達miRNAs及其靶基因
    2.2.4  靶基因的GO註釋及KEGG通路分析
    2.2.5  miRNAs及其靶基因的調控網路
    2.2.6  miRNAs及其靶基因表達的qRT-PCR驗證
  2.3  結果與分析
    2.3.1  高溫處理小RNA文庫構建及測序結果
    2.3.2  高溫脅迫下水稻miRNAs的鑒定
    2.3.3  高溫脅迫下差異表達miRNAs及其靶基因的鑒定
    2.3.4  高溫脅迫下兩個水稻品種中靶基因的預測和GO分析
    2.3.5  高溫脅迫下兩個水稻品種中靶基因的KEGG通路及調控網路分析
    2.3.6  高溫脅迫下9311中靶基因的GO分析
    2.3.7  高溫脅迫下9311中靶基因的KEGG通路及調控網路分析
    2.3.8  高溫脅迫下N22中靶基因的GO分析
    2.3.9  高溫脅迫下N22中靶基因的KEGG通路及調控網路分析
    2.3.10  高溫脅迫下兩個水稻品種中差異表達miRNAs及其靶基因的表達驗證
  2.4  討論
    2.4.1  小RNA測序序列質量分析
    2.4.2  水稻高溫脅迫應答相關miRNAs的篩選及表達特徵
    2.4.3  靶基因的鑒定及其功能分析
  2.5  結論
  參考文獻
第3章  水稻miR398響應高溫脅迫的功能研究
  3.1  試驗材料
    3.1.1  試驗所需材料
    3.1.2  菌株與質粒
    3.1.3  試劑
  3.1  ，4儀器
  3.2  試驗方法
    3.2.1  水稻MIR398a前體過表達載體構建
    3.2.2  重組載體pBI121-MIR398a質粒的提取
    3.2.3  水稻遺傳轉化
    3.2.4  OE-MIR398a前體過表達水稻株系檢測

    3.2.5  OE-MIR398a、STTM398株系的形態學特徵
    3.2.6  OE-MIR398a、STTM398株系基因表達檢測
    3.2.7  OE-MIR398a、STTM398株系高溫脅迫處理及生理指標檢測
    3.2.8  OE-MIR398a、STTM398株系的光合特性
  3.3  結果與分析
    3.3.1  OE-MIR398a前體過表達載體的構建及農桿菌轉化
    3.3.2  重組質粒的水稻遺傳轉化及植株再生
    3.3.3  OE-M1R398a前體過表達株系的GUS檢測及組織化學染色分析
    3.3.4  OE-MIR398a、STTM398株系的形態學特徵分析
    3.3.5  高溫脅迫下OE-MIR398a、STTM398株系的表型及表達分析
    3.3.6  高溫脅迫下OE-MIR398a、STTM398株系生理指標的動態變化
    3.3.7  OE-MIR398a、STTM398株系的光合特性分析
  3.4  討論
    3.4.1  OE-MIR398a、STTM398株系的形態學特徵
    3.4.2  OE-MIR398a、STTM398植株響應高溫脅迫的表達分析
    3.4.3  OE-MIR398a、STTM398株系響應高溫脅迫的生理響應
  3.5  結論
  參考文獻
第4章  水稻miR398及其靶基因的作用機制研究
  4.1  試驗材料
    4.1.1  供試材料
    4.1.2  菌株與質粒
    4.1.3  試劑
  4.2  試驗方法
    4.2.1  總RNA的提取
    4.2.2  RLM-5'RACE驗證水稻miR398a與靶基因OsCSD2的切割
    4.2.3  CRISPR/Cas9-CSD2敲除載體構建
    4.2.4  T0 代CRISPR/Cas9-CSD2突變體植株的檢測
    4.2.5  T1代突變體植株T-DNA-free分析
    4.2.6  T2代水稻突變體株系形態學觀察統計
    4.2.7  高溫脅迫下T2代突變株系的表型及表達檢測
    4.2.8  靶基因OsCSD2的克隆
  4.3  結果與分析
    4.3.1  總RNA的提取分析
    4.3.2  水稻miR398a及其靶基因OsCSD2的切割位點分析
    4.3.3  CRISPR/Cas9-CSD2載體構建及水稻遺傳轉化分析
    4.3.4  T0代水稻CSD2突變位點分析
    4.3.5  T1代突變株系T-DNA-free分析
    4.3.6  CSD2位點T2代突變株系形態學觀察統計
    4.3.7  高溫脅迫下CSD2基因T2代突變體的耐熱性分析
    4.3.8  靶基因OsCSD2的克隆分析
  4.4  討論
    4.4.1  水稻miR398a與靶基因OsCSD2的靶向作用
    4.4.2  靶基因OsCSD2的敲除和克隆
  4.5  結論
  參考文獻
第5章  水稻J蛋白家族的鑒定及高溫脅迫下表達分析
  5.1  材料與方法
    5.1.1  水稻J蛋白家族成員的鑒定
    5.1.2  水稻J蛋白基因結構、保守結構域、系統發育分析

    5.1.3  水稻J蛋白的染色體定位
    5.1.4  水稻J蛋白組織特異性表達分析
    5.1.5  高溫脅迫處理及高通量測序分析
  5.2  結果與討論
    5.2.1  水稻J蛋白家族的鑒定及分析
    5.2.2  水稻J蛋白基因結構、蛋白結構域及系統發生分析
    5.2.3  水稻J蛋白家族的染色體定位
    5.2.4  水稻J蛋白基因的組織特異性表達
    5.2.5  水稻J蛋白基因應答高溫脅迫的表達分析
    5.2.6  水稻J蛋白參與HSP70的調控機制
  5.3  結論
  參考文獻
第6章  水稻GATA基因家族的鑒定及表達分析
  6.1  材料與方法
    6.1.1  材料與數據來源
    6.1.2  水稻GATA家族蛋白序列多重比對方法
    6.1.3  水稻GATA家族蛋白域GATA分析方法
    6.1.4  水稻GATA家族基因表達譜分析方法
  6.2  結果與分析
    6.2.1  水稻OsGATA家族蛋白序列比對及分析
    6.2.2  水稻OsGATA家族蛋白GATA保守結構域分析
    6.2.3  水稻OsGATA家族蛋白三級結構分析
    6.2.4  水稻OsGATA家族基因表達譜分析
  6.3  討論
  6.4  結論
  參考文獻
第7章  水稻鋅指蛋白基因OsBBX22響應高溫脅迫的功能分析
  7.1  材料與方法
    7.1.1  供試材料
    7.1.2  主要試劑及引物
    7.1.3  OsBBX22生物信息學分析
    7.1.4  OsBBX22-RNAi轉基因水稻株系的表達驗證
    7.1.5  水稻OsBBX22響應熱脅迫的表型、表達分析
    7.1.6  水稻葉片過氧化氫（H2O2）原位定位
  7.2  結果與分析
    7.2.1  OsBBX22生物信息學分析
    7.2.2  OsBBX22-RNAi轉基因株系的表達驗證
    7.2.3  水稻OsBBX22響應熱脅迫的表型分析
    7.2.4  水稻OsBBX22響應熱脅迫的表達分析
    7.2.5  水稻葉片過氧化氫（H2O2）原位定位
  7.3  討論
  7.4  結論
  參考文獻

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