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藥物靶點發現與確證(精)

  • 作者：編者:(德)A.T.普羅萊特|責編:楊燕玲|譯者:白仁仁
  • 出版社：化學工業
  • ISBN：9787122459701
  • 出版日期：2024/11/01
  • 裝幀：精裝
  • 頁數：317
人民幣：RMB 198 元      售價：元
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內容大鋼
    本書詳盡介紹了藥物靶點的發現與確證，通過化學、生物和計算方法等方面相關技術的詳細介紹和成功研發實例的展示，清晰闡述了如何克服藥物的開發中的技術障礙，順利發現可進入臨床試驗的新葯靶點。本書還重點介紹了化學蛋白質組學、基於活性的蛋白質圖譜、通路圖譜、全基因組關聯研究、高含量表型圖譜和遺傳操作等先進技術。
    本書深入淺出，有理論、有方法、有案例，可為藥學研發領域的科研工作者和院校師生提供全面而有價值的指導。
作者介紹
編者:(德)A.T.普羅萊特|責編:楊燕玲|譯者:白仁仁
目錄
第1章  評估新葯靶點的化學策略
  1.1  引言
  1.2  化學基因組化合物和化學探針的使用和研究案例
    1.2.1  化學基因組學庫
    1.2.2  無活性對照
    1.2.3  生物靶點組的使用和分析
  1.3  化學探針的開發
    1.3.1  從BIX01294至EPZ035544：G9a/GLP抑製劑的開發和優化
    1.3.2  BRD9抑製劑的開發
  1.4  基於患者來源細胞的化合物靶點評估
    1.4.1  基於化合物的靶點評估
    1.4.2  患者來源的細胞測試
    1.4.3  靶點評估的方法
    1.4.4  案例：炎性腸病組織平台
  1.5  總結與展望
  參考文獻
第2章  基於親和力的化學蛋白質組學靶點識別
  2.1  引言
  2.2  分子表型作用機制的闡明
  2.3  蛋白質檢測讀出的定量高解析度質譜法
  2.4  基於裂解物親和性的化學蛋白質組學
    2.4.1  親和探針的設計
    2.4.2  常規實驗的下拉工作流程
    2.4.3  限制
  2.5  基於細胞內光親和力的化學蛋白質組學
    2.5.1  PAL探針的設計
    2.5.2  常規實驗工作流程
    2.5.3  限制
  2.6  靶點確證和作用方式
  2.7  總結
  參考文獻
第3章  化學蛋白質組學技術
  3.1  引言
  3.2  基於活性的探針和基於親和力的探針設計
    3.2.1  活性部分（反應基團）
    3.2.2  報告標籤
    3.2.3  連接臂
    3.2.4  生物正交化學
  3.3  化學蛋白質組學工作流程
    3.3.1  質譜定量蛋白質組學
  3.4  ABPP應用及案例研究
    3.4.1  案例研究1：基於活性的蛋白質分析是一種嗜極古菌中?鑒定和篩選的強大方法
    3.4.2  案例研究2：脂肪酸?胺水解?抑製劑的臨床試驗失敗
    3.4.3  案例研究3：小分子抑製劑的靶點識別
    3.4.4  案例研究4：光親和標記輔助的基於片段的配體發現
    3.4.5  案例研究5：基於猝滅熒光活性的探針（qABP）設計及其在蛋白質定位中的應用
  3.5  總結
  參考文獻
第4章  激?微球：一種用於激?抑製劑選擇性表徵和靶點發現的化學蛋白質組學方法
  4.1  化學蛋白質組學在激?抑製劑靶點解析中的應用

    4.1.1  小分子激?抑製劑的多靶點效應
    4.1.2  激?抑製劑的化學蛋白質組學分析
    4.1.3  化學蛋白質組學實驗開發的技巧和建議
  4.2  Kinobeads的詳細實驗方案
    4.2.1  細胞或組織裂解液
    4.2.2  親和基質
    4.2.3  Kinobeads競爭性實驗
    4.2.4  質譜檢測
    4.2.5  多?及蛋白質的鑒定與定量
    4.2.6  數據分析
  4.3  Kinobeads的應用案例
    4.3.1  Kinobeads靶點覆蓋面的擴展
    4.3.2  小分子激?抑製劑的靶點解析
    4.3.3  抑製劑多靶點效應的機遇：藥物再定位
    4.3.4  化學蛋白質組學導向的藥物化學
  4.4  Kinobeads、抑製劑和藥物發現：路在何方？
    4.4.1  什麼是好的藥物？
    4.4.2  如何在未來發現新葯？
    4.4.3  化學蛋白質組學導向的藥物發現的陰陽機制
  參考文獻
第5章  用於靶點發現和確證的非標記技術
  5.1  引言
  5.2  CETSA技術的研究
  5.3  細胞熱轉移分析的設計
    5.3.1  經典的細胞熱轉移分析
    5.3.2  細胞熱轉移分析的高通量篩選
    5.3.3  細胞熱轉移分析的質譜分析
  5.4  靶點發現
    5.4.1  活性苗頭化合物的生成
    5.4.2  工具生成（用於識別工具化合物的小型篩選）
    5.4.3  範圍內外和困難的靶點
    5.4.4  聚焦或迭代庫的篩選
    5.4.5  片段庫篩選
    5.4.6  苗頭化合物的確認
    5.4.7  基於表型苗頭化合物去卷積化的靶點發現
  5.5  靶點確證
    5.5.1  結合模式
    5.5.2  選擇性、特異性和安全性
    5.5.3  從實驗到臨床（基於動物實驗）
  5.6  總結
  參考文獻
第6章  支持高效藥物靶點選擇和分層醫學的逆向翻譯
  6.1  引言
  6.2  藥物發現中的遺傳學
  6.3  靶點發現的遺傳學策略
    6.3.1  全基因組關聯分析研究
    6.3.2  罕見病遺傳學
    6.3.3  體細胞突變
    6.3.4  分析方法
  6.4  功能確證

    6.4.1  假定突變的優先順序
    6.4.2  確定突變的功能結果
    6.4.3  可成藥性：從基因確證到可藥用靶點
  6.5  前瞻性展望
    6.5.1  疾病的分子分類學
    6.5.2  精準醫療
    6.5.3  數據整合
  6.6  總結
  參考文獻
第7章  基於人體細胞模型系統的靶點生物學和藥物作用機制
  7.1  引言
  7.2  人體細胞模型開發的研究進展
    7.2.1  第二代測序
    7.2.2  CRISPR基因組編輯
    7.2.3  誘導多能幹細胞生物學
    7.2.4  3D細胞和類器官模型
    7.2.5  微流控和器官晶元設備
    7.2.6  活體成像
    7.2.7  高內涵成像
  7.3  靶點生物學和藥物作用機制的多參數高內涵表型鑒定
    7.3.1  功能基因組學中的高內涵細胞成像
    7.3.2  多參數高內涵成像與化學信息學的結合
    7.3.3  多參數高內涵分析指導化學設計和靶點選擇性
  7.4  用於表型篩選和作用機制測試的靶點註釋化合物庫
  7.5  跨越新模型系統的定量通路分析
    7.5.1  基因轉錄水平上的通路分析
    7.5.2  跨劑量反應和時間序列研究的動態翻譯后通路分析
  7.6  總結
  參考文獻
第8章  靶點確證中的細胞生物學方法
  8.1  引言
  8.2  生物標誌物
    8.2.1  直接靶點參與生物標誌物
    8.2.2  間接靶點參與生物標誌物和通路生物標誌物
    8.2.3  響應生物標誌物
    8.2.4  生物標誌物間的相關性
  8.3  靶點調控引起細胞響應的直接證據
  8.4  通過突變賦予對現有藥物敏感性的方式得到靶點調控導致細胞反應的直接證據
    8.4.1  「碰撞-孔洞」方法獲得敏感性小分子抑製劑
    8.4.2  誘導蛋白質靶點降解的化學基因組學方法
  8.5  耐藥性突變
  參考文獻
第9章  靶點識別和確證的遺傳操作與調節
  9.1  引言
  9.2  主要遺傳操作技術的發展概況
    9.2.1  RNAi、ZFN和TALEN
    9.2.2  規律成簇間隔短迴文重複序列
  9.3  設計和闡釋CRISPR實驗的注意事項
    9.3.1  CRISPR/Cas技術進行遺傳操作的方法學思考
    9.3.2  細胞模型的選擇：生物學和基因組學方面

    9.3.3  gRNA設計
    9.3.4  CRISPR/Cas技術的成功應用
  9.4  CRISPR/Cas技術的進一步發展促進了遺傳擾動的其他模式
    9.4.1  CRISPRi
    9.4.2  CRISPRa
    9.4.3  基礎編輯
  9.5  CRISPR/Cas技術在靶點識別和確證中的應用
    9.5.1  用於早期靶點確證的CRISPR/Cas技術
    9.5.2  CRISPR篩選及其靶點識別
    9.5.3  CRISPR篩選：一般原則和注意事項
    9.5.4  CRISPR篩選應用範圍的靶點識別示例
  9.6  CRISPR基因組編輯在免疫學研究中的應用
  9.7  總結
  參考文獻
第10章  靶點推斷的計算方法
  10.1  引言
  10.2  用於靶點識別的數據註釋
  10.3  靶點識別的計算方法
    10.3.1  靶點推斷的2D相似性方法
    10.3.2  靶點推斷的3D相似性方法
    10.3.3  基於片段的方法
    10.3.4  QSAR模型與機器學習
    10.3.5  實驗衍生的分子描述符
    10.3.6  基於結構的篩選
    10.3.7  蛋白質-蛋白質和配體-靶點網路
  10.4  實際考量
  10.5  總結
  參考文獻
第11章  生物信息學方法在作用機制理解中的應用
  11.1  引言：生物信息學介紹
    11.1.1  相關定義：作用機制與作用模式
    11.1.2  MoA和靶點預測在藥物發現過程中的重要性
    11.1.3  MoA與靶點預測中的不同層次信息
  11.2  轉錄組學數據和資料庫
    11.2.1  轉錄過程的生物學背景
    11.2.2  基因表達關聯性圖譜資料庫
    11.2.3  基於集成網路的細胞特徵文庫LINCS
  11.3  通路數據和資料庫
    11.3.1  什麼是通路？
    11.3.2  通路分析過程
    11.3.3  MoA理解中的通路
    11.3.4  基因表達和通路數據的結合
  11.4  基於圖像的數據
    11.4.1  圖像數據及其提取
    11.4.2  基於圖像的數據在靶點預測和更好理解MoA中的應用
  11.5  總結
  致謝
  參考文獻
索引

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