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單顆粒熒光成像研究GPCR運動與聚集

  • 作者:王倩//郭鋼//黃方|責編:庄嘉翠
  • 出版社:中國石化
  • ISBN:9787511475008
  • 出版日期:2024/04/01
  • 裝幀:平裝
  • 頁數:126
人民幣:RMB 68 元      售價:
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內容大鋼
    G蛋白偶聯受體(GPCR)是一大類橫跨細胞膜的受體蛋白,目前僅見於真核生物中,並參與諸多細胞信號轉導過程。GPCR的生物功能既與其單體形式有關,也與其聚集體形式相關。其中,C家族GPCR已經被公認為會形成受體聚集體。當前,單分子熒光技術常使用基因表達的熒光蛋白和光學穩定性欠佳的有機熒光染料作為標記物,在研究GPCR的聚集與動態相互作用時受到諸多限制。本書將介紹以熒光性能優異的碳點作為GPCR標記物,結合機器學習演算法,建立實時、快速、準確的單顆粒熒光成像技術,實現GPCR運動、聚集與功能的研究。其中的研究內容將有助於讀者更深入了解CXCR4蛋白的結構與功能,指導趨化因子受體相關藥物的發展與設計。

作者介紹
王倩//郭鋼//黃方|責編:庄嘉翠

目錄
1  緒論
  1.1  GPCR簡介及運動與聚集的研究意義
  1.2  受體聚集傳統的研究方法
    1.2.1  免疫共沉澱
    1.2.2  熒光共振能量轉移
    1.2.3  生物共振能量轉移
  1.3  單分子熒光技術
    01.3.1  熒光相關光譜
    11.3.2  單分子熒光成像
  1.4  單分子熒光成像發展趨勢
    1.4.1  單分子熒光成像與納米顆粒結合
    1.4.2  人工智慧輔助單分子熒光成像
  1.5  CXCR4聚集的研究現狀
  1.6  主要研究內容及擬解決的關鍵問題
2  基於非閃爍碳點的活細胞膜上CXCR4示蹤
  2.1  前言
  2.2  實驗材料與儀器
    2.2.1  實驗材料
    2.2.2  實驗儀器
  2.3  實驗方法
    2.3.1  非閃爍碳點的製備
    2.3.2  非閃爍碳點的表徵
    2.3.3  非閃爍碳點與IgG結合
    2.3.4  細胞復甦與培養
    2.3.5  CXCR4-EGFP質粒獲取及轉染表達
    2.3.6  細胞成像
  2.4  結果與討論
    2.4.1  非閃爍碳點的形貌表徵
    2.4.2  非閃爍碳點的性質表徵
    2.4.3  非閃爍碳點的單顆粒光學性質表徵
    2.4.4  非閃爍碳點細胞毒性評估
    2.4.5  CXCR4的單顆粒示蹤
  2.5  本章小結
3  基於深度學習的CXCR4動態過程單顆粒示蹤研究
  3.1  前言
  3.2  實驗材料與儀器
    3.2.1  實驗材料
    3.2.2  實驗儀器
  3.3  實驗方法
    3.3.1  CXCR4免疫標記及全內反射熒光成像
    3.3.2  深度學習模型數據集構建
    3.3.3  深度學習模型訓練
    3.3.4  其他機器學習模型
    3.3.5  配體刺激
    3.3.6  受體成像與示蹤
  3.4  結果與討論
    3.4.1  深度學習模型構架
    3.4.2  深度學習模型評估
    3.4.3  與其他深度學習模型對比
    3.4.4  深度學習模型驗證

    3.4.5  深度學習模型可視化
    3.4.6  CXCR4單體與複合物的判定及統計
    3.4.7  配體調控受休聚集動態過程
    3.4.8  實時跟蹤受體複合物的形成
    3.4.9  表達水平依賴的CXCR4複合物
    3.4.10  實時跟蹤CXCR4內化
  3.5  本章小結
4  基於深度學習的CXCR4聚集狀態識別和聚集機制研究
  4.1  前言
  4.2  實驗材料與儀器
    4.2.1  實驗材料
    4.2.2  實驗儀器
  4.3  實驗方法
    4.3.1  碳點的製備與表徵
    4.3.2  碳點與抗體結合
    4.3.3  受體的免疫染色及成像
    4.3.4  深度學習模型數據集
    4.3.5  深度學習模型訓練
    4.3.6  深度學習模型對比及優化
  4.4  結果與討論
    4.4.1  深度學習模型構架
    4.4.2  深度學習模型評估
    4.4.3  深度學習模型可視化
    4.4.4  模型的t-SNE驗證
    4.4.5  CXCR4的聚集
    4.4.6  CXCR4聚集的調控
    4.4.7  CXCR4聚集機制探究
  4.5  本章小結
結論
參考文獻
附表

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