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複雜組學數據的統計方法及應用研究

  • 作者:單娜陽|責編:徐燕萍
  • 出版社:首都經貿
  • ISBN:9787563837427
  • 出版日期:2024/09/01
  • 裝幀:平裝
  • 頁數:125
人民幣:RMB 38 元      售價:
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內容大鋼
    隨著高通量技術的快速發展,多組學數據在生物學和臨床研究中應用得越來越廣泛。這些豐富的實驗數據揭示了新的致病原理,成為精準醫學研究的重要支撐。然而,高維度、複雜相關性的組學數據分析也給統計學家提出嚴峻的挑戰。
    本書研究了面向複雜組學數據的統計建模和計算問題,包括表達數量性狀位點的識別,複雜疾病遺傳風險預測,以及乳腺癌患者多組學數據的挖掘分析,旨在為理解複雜疾病的發生機制和遺傳風險預測提供一些理論價值和實際應用價值。

作者介紹
單娜陽|責編:徐燕萍
    單娜陽,現為首都經濟貿易大學統計學院數理統計系講師、碩士生導師。博士畢業於清華大學統計學專業,耶魯大學生物統計系訪問學者。主要研究方向為生物統計、生物信息學等,主持國家自然科學基金青年項目。

目錄
第1章  緒論
  1.1  研究背景及意義
    1.1.1  單核?酸多態性
    1.1.2  全基因組關聯分析
    1.1.3  表達數量性狀位點
    1.1.4  全轉錄組關聯分析
  1.2  研究現狀與趨勢
    1.2.1  遺傳機制分析
    1.2.2  遺傳風險預測
  1.3  本書框架與內容
第2章  基於多重中介模型識別反式-表達數量性狀位點
  2.1  引言
  2.2  中介模型
    2.2.1  單一中介模型
    2.2.2  多重中介模型
    2.2.3  中介模型的模型假設
  2.3  模擬數據分析
    2.3.1  模擬數據設置
    2.3.2  模擬數據結果
  2.4  實際數據描述及預處理
    2.4.1  數據描述
    2.4.2  基因型數據預處理
    2.4.3  基因表達數據預處理
    2.4.4  基因表達數據中的人群分層和混雜因素
    2.4.5  eQTL分析
    2.4.6  富集分析
  2.5  實際數據分析結果
    2.5.1  富集分析結果
    2.5.2  trans-eQTL分析結果
  2.6  本章小結
第3章  轉錄組多基因風險評分方法
  3.1  引言
  3.2  轉錄風險評分
    3.2.1  轉錄風險評分
    3.2.2  基準方法LDpred和AnnoPred
    3.2.3  方法評估
  3.3  模擬數據分析
    3.3.1  模擬數據設置
    3.3.2  模擬數據結果
  3.4  實際數據分析
    3.4.1  數據描述
    3.4.2  基因型填充
    3.4.3  WTCCC數據集的結果
    3.4.4  meta-GWAS數據集的結果
  3.5  本章小結
第4章  tRNA衍生片段與T細胞活化在乳腺癌患者生存中的相互作用研究
  4.1  引言
  4.2  乳腺癌患者數據
  4.3  數據分析方法
    4.3.1  統計分析

    4.3.2  功能通路分析
  4.4  實際數據分析
    4.4.1  tRNA衍生片段與患者生存的相關性
    4.4.2  患者生存中T細胞活化狀態與tRNA衍生片段的相互作用
    4.4.3  tRNA衍生片段與臨床病理變數的相關性
    4.4.4  tRNA衍生片段與mRNA的相關性
    4.4.5  tRNA衍生片段與基因模塊的相關性
  4.5  本章小結
第5章  總結與展望
  5.1  研究總結
  5.2  未來研究展望
參考文獻
附錄A  第2章相關表格
附錄B  第4章相關表格

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