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直翅目昆蟲線粒體基因組的比較及譜系基因組學分析

作者：常會會|責編:潘琦
出版社：東北林大
ISBN：9787567433991

出版日期：2023/12/01
裝幀：平裝
頁數：101

人民幣：RMB 49 元售價：元

內容大鋼

本書對線粒體基因組數據的獲取、基因組的組裝和註釋方法進行了概述，並對基於一代測序和高通量測序測定46個直翅目物種的線粒體基因組的研究工作進行總結，以蝗總科的異歧蔗蝗、無齒稻蝗的線粒體基因組序列為例，對直翅目物種線粒體基因組的結構、鹼基組成、氨基酸的使用、密碼子使用頻率、RNA二級結構、控制區特徵等方面進行簡單介紹。然後從比較基因組學角度對直翅目142個物種的mtDNA序列的大小、基因重排、鹼基組成、密碼子使用、氨基酸組成等方面進行比較分析。再從譜系基因組學角度利用直翅目171個物種的mtDNA數據進行了異質性、替換飽和等方面的分析，並通過數據劃分選擇模型構建系統發生樹，對直翅目物種系統發生進行探討。直翅目線粒體基因組數據的增加，將會為研究線粒體基因組進化特徵和構建更加穩健的系統發生關係提供新數據，為構建更加穩健的直翅目系統發生關係和研究mtDNA進化特徵提供新支撐。

作者介紹

常會會|責編:潘琦
常會會，女，出生於1991年10月，河南周口人，畢業於陝西師範大學，現就職于河南城建學院生命科學與工程學院，主要從事分子進化、系統發生學和生物信息學研究，參與國家自然科學基金、省級項目和中央高校項目多項，發表SCI科研論文多篇。

第1章  緒論
  1.1  線粒體及線粒體基因組簡介
  1.2  線粒體基因組研究策略及方法
  1.3  比較基因組學
  1.4  譜系基因組學
  1.5  直翅目系統發生中存在的問題
第2章  線粒體基因組組裝與註釋
  2.1  總DNA的提取及質量檢測
  2.2  基於PCR擴增和一代測序的mtDNA測定方法
  2.3  基於高通量測序的mtDNA測定方法
  2.4  線粒體基因組的註釋
  2.5  線粒體基因組組成分析
第3章  直翅目線粒體基因組測定和分析實例
  3.1  試驗材料與方法
  3.2  總DNA提取、測序、組裝及註釋
  3.3  線粒體基因組組成與分析
第4章  直翅目線粒體比較基因組學分析
  4.1  線粒體基因組大小
  4.2  線粒體基因組基因重排
  4.3  線粒體基因組的間隔區和重疊區
  4.4  線粒體基因組基因長度的變化
  4.5  線粒體基因組鹼基組成
  4.6  線粒體基因組密碼子組成
  4.7  線粒體基因組氨基酸組成
  4.8  線粒體基因組tRNA基因與rRNA基因
  4.9  線粒體基因組D-Loop區比較
第5章  直翅目線粒體譜系基因組學分析
  5.1  數據來源
  5.2  數據集的構建與評估
  5.3  進化模型選擇
  5.4  系統發生樹的構建
  5.5  直翅目線粒體譜系基因組學分析結果與討論
參考文獻

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