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藥物設計學(全國高等教育藥學類規劃教材)

  • 作者：編者:唐贇|責編:褚紅喜//宋林青
  • 出版社：化學工業
  • ISBN：9787122359933
  • 出版日期：2020/01/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：361
人民幣：RMB 68 元      售價：元
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內容大鋼
    《藥物設計學》全書共四篇：導論篇、基礎篇、方法篇、應用篇。其中導論篇（第1章）總體介紹藥物、藥物發現、藥物設計等基本概念，以及藥物設計的發展歷程、主要特性；基礎篇（第2?5章）主要介紹藥物設計學的分子基礎、理論基礎、信息學基礎以及傳統藥物設計知識；方法篇（第6?9章）主要介紹藥物靶標識別和預測方法、電腦輔助先導化合物發現方法、電腦輔助先導化合物優化方法、臨床前研究中的葯代動力學性質與毒性預測方法；應用篇（第10章）則為讀者選取了幾個成功的藥物設計實例。本書從基本概念入手，兼顧基礎知識、基本技能和應用實例，整體內容深入淺出，寫作語言淺顯易懂，章節體系與其它同名教材有較大不同，在傳統藥物設計的基礎上，重點突出電腦輔助藥物設計。
    《藥物設計學》可作為全國高等醫藥院校藥學專業及相關專業的本科生、研究生教材，也可供從事新葯研究和開發的科研人員參考。
作者介紹
編者:唐贇|責編:褚紅喜//宋林青
目錄
緒論
    0.1  藥物設計學的形成與發展
    0.2  學習藥物設計學的意義
    0.3  本書內容簡介
    思考題
    參考文獻
第一篇  導論篇
  第1章  藥物設計概述
    1.1  什麼是藥物？
    1.1.1  藥物的基本概念
    1.1.2  藥物的主要屬性
    1.1.3  藥物的主要來源
    1.1.4  藥物發現的歷史回顧
    1.2  什麼是藥物設計？
    1.2.1  藥物設計的基本概念
    1.2.2  藥物設計的主要特性
    1.2.3  藥物設計的起源
    1.2.4  藥物設計的發展歷程
    1.3  一個經典的藥物設計實例
    1.3.1  靶標確定
    1.3.2  先導化合物發現
    1.3.3  靶標結構模型設想
    1.3.4  先導化合物結構優化
    1.3.5  卡托普利誕生的意義
    1.4  藥物設計所需的知識、技能和條件
    本章小結
    思考題
    參考文獻
    拓展閱讀
第二篇  基礎篇
  第2章  藥物設計的分子基礎
    2.1  概述
    2.2  藥物分子結構特徵
    2.2.1  手性
    2.2.2  類藥性
    2.2.3  藥物分子結構解析
    2.2.4  配體效率
    2.3  靶標分子結構特徵
    2.3.1  蛋白質
    2.3.2  糖
    2.3.3  核酸
    2.4  藥物-靶標相互作用原理
    2.4.1  藥物作用的分子藥理學基礎
    2.4.2  藥物-靶標相互作用模式
    2.4.3  藥物-靶標相互作用類型
    本章小結
    思考題
    參考文獻
    拓展閱讀
  第3章  藥物設計的理論基礎

    3.1  概述
    3.2  分子模擬基本知識
    3.2.1  幾個常用名稱
    3.2.2  分子文件格式
    3.3  量子力學
    3.3.1  量子力學的起源
    3.3.2  量子力學基本理論
    3.3.3  量子力學計算方法
    3.3.4  量子化學在藥物研究中的應用
    3.4  分子力學
    3.4.1  分子力學力場
    3.4.2  常用的分子力場
    3.4.3  分子力學與量子力學比較
    3.5  分子動力學
    3.5.1  分子動力學基本原理
    3.5.2  常用分子動力學方法
    3.5.3  分子動力學模擬的應用
    3.6  結合自由能計算
    3.6.1  自由能微擾和熱力學積分方法
    3.6.2  基於經驗方程的結合自由能計算方法
    3.6.3  基於分子動力學採樣的自由能預測方法
    本章小結
    思考題
    參考文獻
    拓展閱讀
  第4章  藥物設計的信息學基礎
    4.1  概述
    4.2  信息學基礎知識
    4.2.1  資料庫基礎
    4.2.2  統計學基礎
    4.3  信息處理的基本方法
    4.3.1  信息處理的一般流程
    4.3.2  學習策略
    4.3.3  統計分析方法
    4.3.4  機器學習方法
    4.3.5  神經網路與深度學習
    4.3.6  模型評價
    4.3.7  模型構建工具
    4.4  化學信息處理
    4.4.1  化學分子結構表達
    4.4.2  分子結構的數學描述
    4.4.3  分子相似性計算
    4.4.4  預測模型構建
    4.4.5  虛擬化合物庫設計
    4.5  生物信息處理
    4.5.1  序列分析
    4.5.2  蛋白質結構預測
    4.5.3  同源模建
    4.5.4  序列比對和結構預測的在線資源和工具
    本章小結

    思考題
    參考文獻
    拓展閱讀
  第5章  傳統藥物設計方法
    5.1  概述
    5.2  先導化合物的發現
    5.2.1  基於天然產物活性成分發現先導化合物
    5.2.2  基於內源性生物活性物質發現先導化合物
    5.2.3  基於藥物的副作用發現先導化合物
    5.2.4  基於藥物的代謝作用發現先導化合物
    5.2.5  化合物庫篩選發現先導化合物
    5.2.6  其它途徑
    5.3  先導化合物優化原則
    5.4  生物電子等排原理
    5.4.1  「生物電子等排體」的由來
    5.4.2  生物電子等排體的類型
    5.4.3  生物電子等排原理的應用
    5.5  前葯原理
    5.5.1  前葯的定義及基本特徵
    5.5.2  前葯設計時需要考慮的問題
    5.5.3  前葯原理的應用
    5.6  拼合原理
    5.7  其它先導化合物優化方法
    本章小結
    思考題
    參考文獻
    拓展閱讀
第三篇  方法篇
  第6章  藥物靶標識別與預測
    6.1  概述
    6.2  靶標識別與確證
    6.3  網路藥理學與靶標預測
    6.4  基於結構的靶標預測
    6.4.1  反向分子對接
    6.4.2  反向藥效團匹配
    6.5  基於配體的靶標預測
    6.5.1  相似性搜索
    6.5.2  機器學習
    6.6  基於網路的靶標預測
    6.6.1  基於網路推理方法
    6.6.2  藥物子結構驅動的網路推理演算法
    6.6.3  基於隨機遊走方法
    6.6.4  基於基因表達譜方法
    6.7  靶標預測方法的應用
    6.7.1  藥物重定位
    6.7.2  活性化合物的潛在靶標預測
    6.8  靶標預測的在線資源和工具
    本章小結
    思考題
    參考文獻

    拓展閱讀
  第7章  電腦輔助先導化合物發現
    7.1  合理藥物設計概述
    7.2  分子對接
    7.2.1  分子對接基本概念
    7.2.2  分子對接的一般流程
    7.2.3  配體構象搜索方法
    7.2.4  受體柔性處理方法
    7.2.5  打分函數
    7.2.6  分子對接工具
    7.2.7  分子對接的應用
    7.3  藥效團模建
    7.3.1  藥效團基本概念
    7.3.2  藥效團特徵
    7.3.3  藥效團模型的構建
    7.3.4  藥效團模型的應用
    7.4  虛擬篩選
    7.4.1  虛擬篩選概念
    7.4.2  基於結構的虛擬篩選
    7.4.3  基於配體的虛擬篩選
    7.4.4  虛擬篩選的應用
    7.5  全新藥物設計
    7.5.1  全新設計的基本概念
    7.5.2  全新設計的一般流程
    7.5.3  全新藥物設計的應用
    7.6  應用實例
    7.6.1  研究背景
    7.6.2  基於結構虛擬篩選發現ERβ選擇性配體
    7.6.3  基於活性化合物的相似性搜索
    7.6.4  ER配體藥效團模型構建
    7.6.5  採用組合虛擬篩選策略發現新型選擇性ERβ配體
    7.6.6  研究小結
    本章小結
    思考題
    參考文獻
    拓展閱讀
  第8章  電腦輔助先導化合物優化
    8.1  概述
    8.2  經典QSAR方法
    8.2.1  QSAR基本概念
    8.2.2  QSAR發展簡史
    8.2.3  QSAR的三個支柱
    8.2.4  QSAR模型構建步驟
    8.2.5  QSAR建模的注意事項
    8.2.6  QSAR應用
    8.2.7  相關軟體和網路資源
    8.33  D-QSAR方法
    8.3.1  CoMFA方法
    8.3.2  CoMSIA方法
    8.3.3  基於靶標結構的3D-QSAR方法

    8.3.4  3D-QSAR應用實例
    8.4  基於結構的先導化合物優化
    8.4.1  分子模擬技術的應用
    8.4.2  基團變換策略
    8.4.3  合環開環策略
    8.4.4  鄰位修飾策略
    8.4.5  ?鍵變換策略
    8.5  骨架躍遷
    8.5.1  骨架的定義
    8.5.2  骨架躍遷的起源和發展
    8.5.3  骨架相似性的量度
    8.5.4  骨架躍遷的方法分類
    8.5.5  骨架躍遷的應用
    8.6  基於性質的先導化合物優化
    8.6.1  分子骨架庫構建
    8.6.2  骨架指紋的定義
    8.6.3  骨架躍遷的程序實現
    8.6.4  ADMET性質優化案例
    本章小結
    思考題
    參考文獻
    拓展閱讀
  第9章  葯代動力學性質與毒性預測
    9.1  概述
    9.2  藥物的體內過程
    9.3  ADMET預測的一般流程
    9.4  藥物理化性質預測
    9.4.1  脂溶性
    9.4.2  水溶性
    9.4.3  pKa值
    9.5  葯代動力學性質預測
    9.5.1  吸收
    9.5.2  分佈
    9.5.3  代謝
    9.6  藥物毒性預測
    9.6.1  藥物毒理學簡介
    9.6.2  計算毒理學的出現和發展
    9.6.3  毒性預測模型
    9.6.4  警示子結構識別
    9.7  相關軟體和網路資源
    本章小結
    思考題
    參考文獻
    拓展閱讀
第四篇  應用篇
  第10章  藥物設計應用實例
    10.1  概述
    10.1.1  基於配體藥物設計的成功實例
    10.1.2  基於結構藥物設計的成功實例
    10.2  靶向神經氨酸?的抗流感病毒藥物設計

    10.2.1  ?抑製劑設計概述
    10.2.2  流感與神經氨酸?
    10.2.3  扎那米韋的設計
    10.2.4  奧司他韋的設計
    10.2.5  案例啟示
    10.3  靶向μ阿片受體的新型鎮痛藥物設計
    10.3.1  GPCR配體設計
    10.3.2  鎮痛葯與阿片受體
    10.3.3  新型鎮痛葯的設計過程
    10.3.4  案例啟示
    10.4  靶向MDM2-p53相互作用界面的抗腫瘤藥物設計
    10.4.1  蛋白-蛋白相互作用
    10.4.2  腫瘤與MDM2-p53相互作用
    10.4.3  MDM2抑製劑的發現歷程
    10.4.4  案例啟示
    10.5  靶向雄激素受體-DNA相互作用界面的抗腫瘤藥物設計
    10.5.1  蛋白質-DNA相互作用
    10.5.2  雄激素受體與前列腺癌
    10.5.3  虛擬篩選獲得苗頭化合物
    10.5.4  CADD輔助先導化合物優化
    10.5.5  案例啟示
    本章小結
    思考題
    參考文獻
    拓展閱讀
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