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植物大數據技術與應用(新農科智慧農業系列教材高等學校十四五農林規劃新形態教材)

  • 作者：編者:李林|責編:郝真真
  • 出版社：高等教育
  • ISBN：9787040601374
  • 出版日期：2023/06/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：287
人民幣：RMB 48 元      售價：元
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內容大鋼
    植物大數據技術是植物學領域基於生物大數據挖掘的生物信息學前沿領域，是作物智能育種的基礎。本書將重點講述植物領域生物大數據挖掘的前沿理論、發展方向與技能，介紹生物大數據的最新技術方法，特別是作物領域生物大數據挖掘中常用的關鍵技術及分析流程，包括植物基因組大數據、轉錄組大數據、蛋白質組大數據、表觀組大數據、代謝組大數據、環境適應性大數據、表型組大數據和互作組網路大數據等內容，以及植物大數據的生物信息學基礎、植物大數據的儲存與管理、植物大數據技術在遺傳解析中的應用等內容。本書提供與紙質版教材內容一體化設計的數字課程，包括編者授課的教學課件、配套彩色圖片和拓展知識等資源；同時，書中採用「示例」的形式，以科研生物大數據為基礎，用真實案例講解大數據挖掘的代碼運行形式，以期達到不僅傳授大數據理論知識，而且可以實際操作的授課目的。
    本書可作為農學、智慧農業等涉農專業的本科生教材，也適用於綜合類和師範類等高校生物信息學相關專業的教學用書，還可作為廣大生命科學研究人員的參考用書。
作者介紹
編者:李林|責編:郝真真
目錄
第一章  緒論
  第一節  大數據時代的到來
  第二節  認識植物大數據
  第三節  植物大數據概述
    一、基因組大數據
    二、轉錄組大數據
    三、蛋白質組大數據
    四、表觀組大數據
    五、代謝組大數據
    六、植物與環境適應性大數據
    七、表型組大數據
    八、整合網路大數據
  第四節  植物大數據的應用
  第五節  植物大數據的未來
第二章  植物大數據的生物信息學基礎
  第一節  生物信息數據及其產生途徑和管理
    一、生物信息數據類型及測序技術
    二、分子資料庫
  第二節  生物信息學統計與演算法基礎
    一、貝葉斯統計
    二、圖論與概率圖模型
    三、機器學習演算法
  第三節  序列聯配演算法
    一、打分矩陣
    二、序列聯配演算法
    三、BLAST演算法
第三章  植物基因組大數據
  第一節  基因組組裝與註釋
    一、基因組調查
    二、基因組組裝與演算法基礎
    三、基於Hi-C和Bionano假染色體定位
    四、轉座子註釋
    五、基因組功能元件註釋
  第二節  比較基因組與進化
    一、基於蛋白質序列的比較基因組分析
    二、基於基因組序列聯配的比較基因組分析
    三、基因組多倍化
  第三節  群體基因組
    一、自然群體的基因組變異類型與檢測
    二、群體基因組進化分析
    三、基因組選擇信號的分析
    四、全基因組關聯分析
    五、泛基因組
  第四節  植物基因組組裝實例
    一、數據來源和軟體
    二、組裝流程
    三、基因組註釋
第四章  植物轉錄組大數據
  第一節  高通量轉錄組測序技術
    一、二代轉錄組測序技術原理

    二、三代全長轉錄組測序技術原理
    三、二代與三代轉錄組測序技術比較
  第二節  轉錄組大數據的應用
    一、轉錄圖譜重構
  ……
第五章  植物蛋白質組大數據
第六章  植物表觀組大數據
第七章  植物代謝組大數據
第八章  植物環境適應性大數據
第九章  植物表型組大數據
第十章  植物互作組網路大數據
第十一章  植物大數據存儲與管理
第十二章  植物大數據技術在遺傳解析中的應用
參考文獻

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