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表觀遺傳學(上下)

  • 作者:編者:于文強//徐國良|責編:羅靜//劉晶
  • 出版社:科學
  • ISBN:9787030737892
  • 出版日期:2023/03/01
  • 裝幀:平裝
  • 頁數:1254
人民幣:RMB 780 元      售價:
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內容大鋼
    表觀遺傳學極大地拓寬了人們對於遺傳信息流動的認知,是后基因組時代生命科學領域研究的前沿和熱點。本書作者均為國內外表觀遺傳學研究領域一線科研工作者,內容涵蓋了表觀遺傳學的所有重大主題和技術應用:第1?31章梳理了表觀遺傳的基礎知識和概念,納入了表觀遺傳領域最新的前沿內容,如環形RNA、lncRNA、NamiRNA、RNA修飾,以及染色質高級結構等;第32?42章為表觀遺傳在重要生命過程中的應用,包括早期胚胎髮育、腫瘤發生髮展等重要生理及病理過程;第43?63章為表觀遺傳核心技術和全新理論解讀與應用展望,為研究者提供了詳盡的操作方法。
    本書具有很強的專業性和實用性,不僅可作為表觀遺傳領域研究者的專業工具書,也可為相關領域的高年級本科生、研究生及對錶觀遺感測興趣的讀者提供一份極具價值的參考資料。

作者介紹
編者:于文強//徐國良|責編:羅靜//劉晶

目錄
第1章  表觀遺傳學概論
  參考文獻
第2章  DNA甲基化
  2.1  DNA甲基化概述
  2.2  DNA甲基化與細胞記憶機制
  2.3  DNA甲基化模式的建立和維持
  2.4  DNA甲基化在基因表達調控中的作用
  2.5  DNA甲基化在哺乳動物中的主要功能
  2.6  DNA甲基化與疾病
  2.7  DNA甲基化相關問題與展望
  參考文獻
第3章  DNA去甲基化
  3.1  DNA去甲基化概述
  3.2  TET概述
  3.3  DNA去甲基化相關問題與展望
  3.4  DNA去甲基化研究面臨的挑戰
  參考文獻
第4章  基因組印記
  4.1  基因組印記概述
  4.2  小鼠的印記基因
  4.3  基因組印記的調控
  4.4  印記基因群區的典型調控模型
  4.5  基因組印記的正常功能
  4.6  印記基因失常與人類疾病
  4.7  基因組印記的起源與進化
  4.8  總結與展望
  參考文獻
第5章  基因劑量補償和X染色體失活
  5.1  性別決定與基因劑量補償的概述
  5.2  哺乳類X染色體失活的發現與簡介
  5.3  X染色體失活的動物模型與分子機制
  5.4  X染色體失活與人類疾病
  5.5  總結與展望
  參考文獻
第6章  組蛋白甲基化修飾
  6.1  蛋白質甲基化研究小史
  6.2  組蛋白甲基化?的種類及催化的修飾類型
  參考文獻
第7章  組蛋白去甲基化
  7.1  組蛋白去甲基化動態調控的研究歷史概述
  7.2  組蛋白去甲基化?的命名
  7.3  組蛋白去甲基化?的生物學功能
  7.4  組蛋白去甲基化?在製藥領域的潛在應用
  參考文獻
第8章  組蛋白乙?化
  8.1  組蛋白乙?化的發現
  8.2  組蛋白乙?化?及其複合物
  8.3  組蛋白去乙?化?和抑製劑
  8.4  乙?化識別蛋白
  8.5  組蛋白乙?化的作用機制及功能

  8.6  組蛋白乙?化與人體生理病理
  8.7  組蛋白乙?化修飾與藥物研發
  8.8  展望
  參考文獻
第9章  組蛋白其他修飾與組蛋白變體
  9.1  組蛋白其他修飾與組蛋白變體概述
  9.2  組蛋白磷酸化修飾
  9.3  組蛋白新型?化修飾
  9.4  基於質譜檢測的組蛋白修飾鑒定與定量分析
  9.5  組蛋白變體
  參考文獻
第10章  組蛋白修飾識別
  10.1  組蛋白修飾識別概述
  10.2  組蛋白修飾識別的分子基礎
  10.3  組蛋白修飾識別的調控機制
  10.4  組蛋白修飾識別的生物學功能
  10.5  組蛋白修飾識別與染色質信號轉導
  10.6  組蛋白修飾識別因子的鑒定方法與技術
  10.7  組蛋白閱讀器靶向的藥物研發
  參考文獻
第11章  染色質重塑
  11.1  染色質重塑概述
  11.2  核小體定位與基因調控
  11.3  組蛋白分子伴侶
  11.4  染色質重塑複合體
  11.5  染色質重塑與疾病
  參考文獻
第12章  染色質結構與組蛋白變體
  12.1  染色體結構
  12.2  組蛋白變體
  參考文獻
第13章  CTCF與三維基因組染色質高級結構
  13.1  CTCF與DNA的相互作用
  13.2  CTCF與黏連蛋白協同架構三維基因組染色質高級結構
  13.3  CTCF與染色質高級結構
  13.4  CTCF與基因表達調控
  13.5  總結與展望
  參考文獻
第14章  Polycomb複合物及Trithorax複合物
  14.1  Polycomb複合物和Trithorax複合物概論
  14.2  Polycomb複合物
  14.3  Trithorax複合物
  14.4  Polycomb複合物和Trithorax複合物相關抑製劑
  14.5  總結與展望
  參考文獻
第15章  DNA甲基化修飾?的結構生物學研究
  15.1  DNA甲基轉移?
  15.2  DNA去甲基化調控?
  參考文獻
第16章  非編碼RNA

  16.1  非編碼RNA概述
  16.2  非編碼RNA種類
  16.3  非編碼RNA特徵、產生及生物學功能
  16.4  非編碼RNA與疾病
  16.5  研究非編碼RNA的方法學
  16.6  總結與展望
  參考文獻
第17章  siRNA
  17.1  RNAi概述
  17.2  siRNA的加工生成
  17.3  RNAi的調控機制
  17.4  RNAi引起的毒副作用
  17.5  RNAi藥物的前景與挑戰
  參考文獻
第18章  RNAa
  18.1  RNAa概述
  18.2  外源性RNAa
  18.3  內源性RNAa
  18.4  線蟲中的RNAa
  18.5  RNAa的應用
  18.6  RNAa領域面臨的問題與展望
  參考文獻
第19章  microRNA概述
  19.1  miRNA的概況
  19.2  miRNA的生物合成
  19.3  miRNA的作用機制
  19.4  miRNA資料庫簡介
  19.5  miRNA的功能與疾病
  19.6  miRNA與疾病診斷和治療
  參考文獻
第20章  NamiRNA
  20.1  miRNA概述
  20.2  增強子與miRNA的關係
  20.3  NamiRNA通過增強子介導基因的激活
  20.4  NamiRNA作用機制
  20.5  NamiRNA研究的展望與挑戰
  參考文獻
第21章  piRNA
  21.1  piRNA的發現、分類與生成
  21.2  piRNA通路的功能及作用機制
  21.3  piRNA機器的代謝
  21.4  piRNA與男性不育
  21.5  總結與展望
  參考文獻
第22章  lncRNA
  22.1  lncRNA的發現和定義
  22.2  lncRNA的鑒定、種類與特徵
  22.3  lncRNA的表達與轉錄后加工
  22.4  lncRNA的調控機制
  22.5  lncRNA的生理功能

  22.6  lncRNA與腫瘤
  參考文獻
第23章  環形RNA
  23.1  環形RNA的發現
  23.2  環形RNA的基本分類
  23.3  環形RNA的自身代謝
  23.4  反向剪接環形RNA的生物學特徵
  23.5  反向剪接環形RNA的功能
  23.6  環形RNA與疾病
  23.7  環形RNA研究展望
  參考文獻
第24章  RNA修飾
  24.1  RNA修飾簡介
  24.2  RNA修飾分佈特徵
  24.3  RNA修飾的生物學功能
  24.4  RNA修飾與生理病理效應
  24.5  總結與展望
  參考文獻
第25章  RNA編輯
  25.1  RNA編輯概述
  25.2  RNA編輯的分類
  25.3  RNA編輯的定位和定量
  25.4  動物中RNA編輯的功能
  25.5  植物中RNA編輯的功能和意義
  25.6  RNA編輯的應用
  25.7  總結
  參考文獻
第26章  DNA甲基化、組蛋白修飾及非編碼RNA的互動與協調
  26.1  DNA甲基化、組蛋白修飾及非編碼RNA的相互關係和調控概論
  26.2  DNA甲基化與組蛋白修飾
  26.3  非編碼RNA與DNA甲基化
  26.4  非編碼RNA與組蛋白修飾
  26.5  DNA甲基化、組蛋白修飾及非編碼RNA三者之間的悖論和挑戰
  參考文獻
第27章  表觀遺傳學與基因可變剪接
  27.1  基因可變剪接的功能和生物學意義
  27.2  基因可變剪接的經典調控
  27.3  組蛋白修飾與基因可變剪接
  27.4  DNA甲基化與基因可變剪接
  27.5  研究展望
  參考文獻
第28章  染色質的空間結構與功能學意義
  28.1  細胞核與染色質的空間組織架構
  28.2  解析染色質3D結構的方法
  28.3  發育過程中動態變化的染色質結構
  28.4  疾病情況下改變的染色質形態
  28.5  總結與展望
  參考文獻
第29章  增強子與細胞身份
  29.1  增強子的概念與定義

  29.2  增強子的表觀遺傳學特徵
  29.3  增強子序列變異及突變與疾病
  參考文獻
第30章  表觀遺傳信息的遺傳
  30.1  表觀遺傳信息的遺傳概述
  30.2  表觀遺傳信息的跨代傳遞
  30.3  有絲分裂中的基因書籤
  30.4  總結與展望
  參考文獻
第31章  表觀遺傳與遺傳的相互作用
  31.1  SNP與基因表觀遺傳調控區域的關係
  31.2  表觀遺傳修飾改變與拷貝數變異
  31.3  唐氏綜合征的表觀遺傳異常
  31.4  遺傳與表觀遺傳學共同決定人的性狀
  參考文獻
第32章  表觀遺傳學與生殖
  32.1  生殖過程概述
  32.2  精子發生和成熟的表觀遺傳特徵
  32.3  卵子發生和成熟中的表觀遺傳調控
  32.4  表觀遺傳異常與不孕不育
  32.5  總結與展望
  參考文獻
第33章  早期胚胎髮育中表觀遺傳信息的傳遞、重編程和調控
  33.1  引言
  33.2  哺乳動物的配子發生和早期胚胎髮育
  33.3  表觀遺傳調控在胚胎髮育中的重要功能
  33.4  研究早期胚胎髮育中表觀遺傳調控的方法
  33.5  配子發生中表觀基因組的建立
  33.6  早期胚胎髮育過程中的表觀遺傳重編程
  33.7  總結與展望
  參考文獻
第34章  表觀遺傳學與重編程
  34.1  重編程概述
  34.2  重編程過程中的表觀遺傳調控
  34.3  總結與展望
  參考文獻
第35章  表觀遺傳學與造血細胞分化及疾病
  35.1  正常造血過程及表觀遺傳調控
  35.2  造血分化異常疾病的表觀遺傳調控
  35.3  表觀遺傳調控因子的相互作用
  35.4  造血異常疾病的表觀遺傳調控
  35.5  總結與展望
  參考文獻
第36章  表觀遺傳與免疫細胞分化及自身免疫病
  36.1  免疫細胞的發育和分化
  36.2  DNA去甲基化與免疫基因激活
  36.3  增強子對免疫細胞分化的調控
  36.4  自身免疫疾病與DNA甲基化
  36.5  組蛋白修飾與自身免疫疾病
  36.6  miRNA與自身免疫疾病

  36.7  總結與展望
  參考文獻
第37章  表觀遺傳學與神經系統疾病
  37.1  表觀遺傳學簡介
  37.2  神經發育疾病中的表觀遺傳學
  37.3  神經退行性疾病中的表觀遺傳學
  37.4  針對錶觀遺傳的潛在治療方法
  37.5  總結與展望
  參考文獻
第38章  表觀遺傳學與孤獨症譜系障礙
  38.1  孤獨症譜系障礙
  38.2  孤獨症譜系障礙與環境因素
  38.3  ASD中的典型基因突變
  38.4  孤獨症譜系障礙與基因組印記異常
  38.5  ASD的表觀遺傳標誌物
  38.6  總結與展望
  參考文獻
第39章  表觀遺傳與分子代謝
  39.1  蛋白質翻譯后修飾
  39.2  代謝基因突變產生致癌代謝物
  39.3  代謝與表觀遺傳研究所面臨挑戰
  39.4  總結與展望
  參考文獻
第40章  表觀遺傳與腫瘤
  40.1  腫瘤的基本特徵
  40.2  腫瘤與表觀遺傳
  40.3  總結與展望
  參考文獻
第41章  表觀遺傳學與人類複雜疾病
  41.1  複雜疾病的遺傳學
  41.2  複雜疾病的表觀遺傳學機制
  41.3  總結與展望
  參考文獻
第42章  環境表觀遺傳學
  42.1  環境毒素與表觀遺傳學變化
  42.2  應對環境污染導致表觀遺傳變異的策略
  參考文獻
第43章  表觀遺傳學與外泌體
  43.1  微囊泡概念及分類
  43.2  外泌體的生物生成
  43.3  外泌體分泌
  43.4  外泌體組成成分
  43.5  外泌體攝取
  43.6  外泌體的生物功能
  43.7  外泌體的應用
  43.8  外泌體的研究方法
  參考文獻
第44章  表觀遺傳相關藥物
  44.1  表觀遺傳重要靶點簡介
  44.2  表觀遺傳藥物的發展現狀

  44.3  表觀遺傳先導化合物的研究現狀
  44.4  表觀遺傳藥物發現的難點和策略
  44.5  表觀遺傳藥物的應用
  44.6  表觀遺傳藥物發展面臨的挑戰及展望
  參考文獻
第45章  基因編輯技術與表觀遺傳調控
  45.1  常見基因編輯方法概述
  45.2  基因組編輯技術在表觀遺傳調控中的應用
  45.3  基因編輯技術定向調控表觀修飾的意義
  45.4  基因編輯定向調控技術的挑戰與展望
  參考文獻
第46章  表觀遺傳分子標誌物
  46.1  表觀遺傳分子標誌物的種類和特點
  46.2  表觀遺傳分子標誌物的實驗評估
  46.3  表觀遺傳分子標誌物的臨床應用
  46.4  表觀遺傳分子標誌物在液體活檢中的運用
  46.5  總結與展望
  參考文獻
第47章  全癌標誌物
  47.1  癌症研究的窘境
  47.2  腫瘤的異質性與共性
  47.3  全癌標誌物
  47.4  全癌標誌物的展望
  參考文獻
第48章  DNA甲基化檢測方法
  48.1  DNA甲基化研究方法概述
  48.2  全基因組整體甲基化水平測定
  48.3  基於甲基化敏感的限制性內切?分析
  48.4  基於免疫親和反應分析法
  48.5  基於亞硫酸氫鹽轉化的甲基化檢測
  48.6  DNA甲基化檢測方法的選擇
  參考文獻
第49章  DNA甲基化組數據的生物信息學分析
  49.1  DNA甲基化組數據類型概述
  49.2  數據分析流程
  49.3  相關前沿研究
  49.4  總結
  參考文獻
第50章  染色質免疫共沉澱技術
  50.1  ChIP方法學概論.
  50.2  ChIP基本方法:ChIP-qPCR
  50.3  ChIP-on-chip
  50.4  ChIP-seq
  50.5  ChIP-exo
  參考文獻
第51章  ChIP的生物信息學
  51.1  ChIP-seq數據概述
  51.2  單個ChIP-seq樣本的預處理和下游分析
  51.3  來自相同細胞狀態的多ChIP-seq樣本整合分析
  51.4  跨細胞狀態的ChIP-seq樣本比較分析

  51.5  ChIP-seq數據分析的挑戰與展望
  參考文獻
第52章  lncRNA的檢測及研究方法
  52.1  概述
  52.2  功能性lncRNA的篩查
  52.3  lncRNA的鑒定
  52.4  lncRNA的表達檢測
  52.5  lncRNA在基因組上的結合位點檢測
  52.6  RNA-蛋白質相互作用的檢測
  52.7  lncRNA自身的表達調控研究
  52.8  總結與展望
  參考文獻
第53章  RNA分析
  53.1  RNA-seq測序數據比對
  53.2  RNA的定量
  53.3  差異表達基因分析
  53.4  其他RNA分析方法
  參考文獻
第54章  RNA修飾的檢測
  54.1  RNA修飾的類型
  54.2  RNA修飾的檢測技術
  參考文獻
第55章  RNA剪接的生物信息學
  55.1  RNA剪接的生物信息學概述
  55.2  可變剪接的預測方法
  55.3  可變剪接預測結果的應用
  55.4  總結與展望
  參考文獻
第56章  3D基因組檢測方法
  56.1  染色質3D結構研究的實驗方法
  56.23  D基因組學生物信息分析
  參考文獻
第57章  單細胞測序技術
  57.1  單細胞測序技術的意義和發展
  57.2  單細胞分離技術
  57.3  單細胞全基因組擴增方法
  57.4  單細胞基因組測序
  57.5  單細胞轉錄組測序
  57.6  單細胞表觀組測序
  57.7  單細胞多組學測序
  57.8  總結與展望
  參考文獻
第58章  核小體定位分析
  58.1  核小體定位分析概述
  58.2  基於?促切割DNA的方式
  58.3  基於?促反應印跡的方式——NOMe-seq
  58.4  基於抗體富集的方式——H3ChIP-seq
  58.5  基於化學或者物理切割DNA的方式
  參考文獻
第59章  蛋白質翻譯后修飾的質譜分析

  59.1  生物質譜的原理和分析方法
  59.2  常見蛋白質翻譯后修飾的質譜分析
  59.3  蛋白質及修飾的信息學分析
  59.4  展望
  參考文獻
第60章  基因編輯方法學
  60.1  基因編輯技術原理
  60.2  ZFN技術
  60.3  TALEN技術
  60.4  CRISPR/Cas9技術
  60.5  其他類型的CRISPR核酸?
  60.6  CRISPR/Cas9特異性-檢測脫靶的方法
  60.7  提高特異性的方法
  60.8  設計sgRNA的網站
  60.9  基因敲除
  60.10  基因敲入
  60.11  糾正基因突變與引入點突變
  60.12  CRISPR/Cas9導入細胞的方法
  60.13  CRISPR/Cas9系統的其他幾種應用
  60.14  總結與展望
  參考文獻
第61章  二代測序樣本製備策略
  61.1  簡介:NGS及文庫構建的關鍵
  61.2  NGS工作流程的基礎:片段化、片段大小選擇及測序方式
  61.3  DNA文庫製備
  61.4  RNA文庫製備
  61.5  NGS文庫構建的注意事項:偏倚、複雜性、批次效應
  61.6  靶向測序和擴增子測序
  61.7  單細胞DNA測序
  61.8  單細胞RNA測序
  61.9  臨床應用
  61.10  染色體免疫沉澱測序
  61.11  RNA免疫沉澱測序
  61.12  甲基化DNA免疫沉澱
  61.13  甲基化測序
  61.14  SHAPE測序
  61.15  其他基於二代測序的應用
  61.16  三代測序系統
  參考文獻
第62章  表觀遺傳學常用軟體及網站介紹
  62.1  ENCODE計劃和Roadmap計劃的介紹
  62.2  表觀遺傳常用數據及軟體資源介紹
  62.3  表觀遺傳常用軟體
  62.4  總結與展望
  參考文獻
第63章  人也序列
  63.1  人也序列概述
  63.2  人也序列作用機制及應用
  63.3  總結與展望
  參考文獻

後記

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