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網路藥理學導論

  • 作者：編者:李梢|責編:趙凱
  • 出版社：清華大學
  • ISBN：9787302619659
  • 出版日期：2022/12/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：236
人民幣：RMB 89 元      售價：元
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內容大鋼
    網路藥理學是大數據和人工智慧時代藥物系統性研究的新興交叉學科，強調從系統層次和生物網路的整體角度出發，解析藥物及其治療對象之間的分子關聯規律。該學科既體現了疾病和藥物系統性研究的新趨勢，又符合中醫藥的整體思維與實踐，為系統理解藥物和疾病相互作用機制、中醫藥複雜體系研究、新葯研發與評價等提供新思路、新方法、新技術，有望促進中西醫藥研究從「還原論」到「系統論」的發展，推動建立「下一代藥物研究模式」。
    本書以「網路靶標—系統調節」理論、方法與應用實踐為主線，全面闡述網路藥理學的發展歷程、網路靶標核心理論、主要研究方法、研究案例、實踐流程。全書共分為9章：第1章介紹網路藥理學概念與理論以及發展歷史；第2、3、4章分別介紹基於人工智慧演算法的網路藥理學在藥物研發中的應用、網路藥理學的常用資料庫與常用軟體；第5、6章分別介紹基於網路藥理學的中醫藥現代化、現代藥物研究的典型案例；第7、8、9章分別介紹基於藥物、疾病的網路藥理學實踐流程。
    本書可作為高等學校中藥藥理學、藥理學、中醫學、中藥學、中西醫結合等專業「網路藥理學」課程的教材，也可作為網路藥理學、系統生物學、生物信息學、網路科學、信息與生命科學交叉學科的教學參考書。
作者介紹
編者:李梢|責編:趙凱
    李梢，醫學博士，清華大學自動化系長聘教授、生命學院兼職教授、博導、清華大學北京市中醫藥交叉研究所所長，國家傑出青年科學基金獲得者、國家萬人計劃領軍人才、世界中醫藥學會聯合會網路藥理學會會長、國家非遺「張一帖」第15代中醫傳人。1999年提出從生物分子網路角度研究中醫藥科學內涵的假說，通過交叉學科的艱苦探索和不懈努力，開闢中醫藥網路藥理學研究方向，並在理論、方法和應用上取得系列重要成果。主持國家基金重點、重大研究計劃等項目10余項，在Cell子刊等發表190余篇論文，被引用6000余次，多篇論文被評為F1000傑出論文、Nature China亮點論文，擁有國內外專利30余項，領銜制定網路藥理學第一個國際標準。成果入選2021中醫藥十大學術進展、2019中國生物信息學十大應用、2019中華中醫藥學會十大學術熱點、2014世界中醫藥十大新聞。獲中醫藥國際貢獻獎一等獎、李時珍醫藥創新獎、國家科技進步二等獎、國家教學成果二等獎、2020中國全面小康十大傑出貢獻人物等獎勵，被國內外學者評價為中醫藥網路藥理學的「開拓者」。
目錄
第1章  網路靶標理論與網路藥理學
  1.1  網路藥理學：下一代藥物研究模式
  1.2  中醫藥在網路藥理學起源和發展中的關鍵作用
  1.3  網路藥理學核心理論：網路靶標
    1.3.1  網路靶標理論的提出與發展
    1.3.2  網路靶標的概念
  1.4  網路藥理學研究模式和特點概述
    1.4.1  「單靶標-局部對抗」研究模式
    1.4.2  「網路靶標-系統調節」研究模式
    1.4.3  網路藥理學分析典型場景
    1.4.4  網路藥理學研究特點、挑戰及發展方向
  參考文獻
第2章  基於人工智慧演算法的網路藥理學在藥物研發中的應用
  2.1  運用於網路藥理學的人工智慧方法介紹
    2.1.1  人工智慧演算法簡介
    2.1.2  人工智慧演算法性能評價方法
    2.1.3  人工智慧方法應用條件
    2.1.4  人工智慧方法的前沿和展望
  2.2  人工智慧在網路藥理學研究中的應用
    2.2.1  藥物靶點的預測和發現
    2.2.2  藥物作用機制的研究
    2.2.3  藥物新用途的發現
    2.2.4  中藥物質基礎與中醫治療理論的研究
  2.3  人工智慧方法的應用展望
  參考文獻
第3章  網路藥理學常用資料庫
  3.1  網路藥理學常用中醫藥資料庫
    3.1.1  ETCM：中醫藥百科全書
    3.1.2  SymMap：關注證候關聯的中醫藥整合資料庫
    3.1.3  BATMAN-TCM：中藥分子機制的生物信息學分析平台
    3.1.4  TCMID：用於中藥分子機制分析的中醫藥整合資料庫
    3.1.5  其他中醫藥資料庫
  3.2  網路藥理學常用生物相關資料庫
    3.2.1  OMIM：人類孟德爾遺傳病在線資料庫
    3.2.2  HPO：人類表型本體資料庫
    3.2.3  DisGeNET：疾病基因關聯資料庫
    3.2.4  MalaCards：疾病信息資料庫
    3.3.1  TTD：治療靶標資料庫
  3.3  網路藥理學常用靶標相關資料庫
    3.3.2  PDB：蛋白質晶體結構資料庫
    3.3.3  GeneCards：基因信息資料庫
    3.3.4  KEGG：京都基因與基因組百科全書
  3.4  網路藥理學常用蛋白相互作用資料庫
    3.4.1  BioGRID：生物學通用相互作用資料庫
    3.4.2  DIP：蛋白質相互作用資料庫
    3.4.3  IntAct：分子相互作用資料庫
    3.4.4  STRING：基因/蛋白相互作用關係資料庫
  參考文獻
第4章  網路藥理學常用軟體
  4.1  網路藥理學軟體功能框架及分類

    4.1.1  總體軟體功能需求
    4.1.2  網路藥理學軟體功能框架及分類
  4.2  網路藥理學常用的Web軟體
    4.2.1  藥物靶標預測Web軟體
    4.2.2  藥物適應症分析Web軟體
    4.2.3  基因功能富集分析Web軟體
    4.2.4  蛋白相互作用網路構建Web軟體
  4.3  基於圖形化界面操作的軟體
    4.3.1  差異基因富集分析軟體
    4.3.2  網路分析軟體
  4.4  基於編程語言的工具包
    4.4.1  C++、Java工具包的使用
    4.4.2  Python、R工具包的使用
  參考文獻
第5章  網路藥理學和中醫藥現代化研究案例
  5.1  網路藥理學與中醫證候研究案例
    5.1.1  寒、熱證候及對證方劑的網路藥理學研究案例分析
    5.1.2  慢性乙型肝炎致肝纖維化的「同病異證」研究案例分析
5、2網路藥理學與中藥方劑研究案例
  5.3  網路藥理學與中藥創製研究案例
  5.4  網路藥理學與民族葯研究案例
  參考文獻
第6章  網路藥理學與現代藥物研發案例
  6.1  複雜疾病內在機制和干預靶標
  6.2  藥物系統性作用機制
  6.3  多靶標藥物研發
    6.3.1  缺血性中風：從單一藥物靶標到協同的網路藥理學
    6.3.2  聯合網路藥理學與表型篩選開發新的止痛類藥物
  6.4  藥物重新定位
    6.4.1  基於網路的藥物重定位預測及基於人群的驗證
    6.4.2  基於網路藥理學的藥物重定位發現新的抗抑鬱藥物
  6.5  組合藥物研發
  參考文獻
第7章  基於藥物的網路藥理學實踐流程
  7.1  尋找單味中藥或方劑的有效成分
    7.1.1  數據採集與處理
    7.1.2  網路構建與可視化
    7.1.3  網路分析與預測
    7.1.4  驗證與總結
  7.2  闡述單味中藥或方劑的藥效機制
    7.2.1  數據採集與處理
    7.2.2  網路構建與可視化
    7.2.3  網路分析與預測
    7.2.4  驗證與總結
  7.3  詮釋中藥配伍理論的科學內涵
    7.3.1  數據採集與處理
    7.3.2  網路構建與可視化
    7.3.3  網路分析與預測
    7.3.4  驗證與總結
  7.4  解釋中藥與西藥之間的相互作用

    7.4.1  數據採集與處理
    7.4.2  網路構建與可視化
    7.4.3  網路分析與預測
    7.4.4  驗證與總結
  7.5  藥物臨床應用的重定位——中藥成分保護腦缺血再灌注損傷的新用途
    7.5.1  數據採集與處理
    7.5.2  網路構建與可視化
    7.5.3  網路分析與預測
    7.5.4  驗證與總結
  7.6  多靶點藥物的開發——中藥配伍保護低密度脂蛋白誘導的內皮細胞損傷
    7.6.1  數據採集與處理
    7.6.2  網路構建與可視化
    7.6.3  網路分析與預測
    7.6.4  驗證與總結
  參考文獻
第8章  基於疾病的網路藥理學實踐流程
  8.1  冠心病疾病網路構建及分析
    8.1.1  數據採集與處理
    8.1.2  網路構建與可視化
    8.1.3  網路分析與預測
    8.1.4  驗證與總結
  8.2  疾病網路用於中藥方劑的研究實踐
    8.2.1  中藥方劑的整合作用機制研究
    8.2.2  中藥方劑的「君臣佐使」配伍規律研究
    8.2.3  中藥方劑的「益氣、活血」功效研究
  參考文獻
第9章  基於藥物-疾病的網路藥理學實踐流程
  9.1  化橘紅治療呼吸系統疾病的網路藥理學研究
    9.1.1  化橘紅治療呼吸系統疾病的作用靶點預測
    9.1.2  化橘紅治療呼吸系統疾病的作用靶點驗證
    9.1.3  化橘紅治療呼吸系統疾病的調控網路分析
  9.2  丹紅注射液治療心血管疾病的網路藥理學研究
    9.2.1  丹紅注射液治療心血管疾病的作用靶點預測
    9.2.2  丹紅注射液治療心血管疾病的作用靶點驗證
    9.2.3  丹紅注射液治療心血管疾病的調控網路分析
  參考文獻
附錄A  網路藥理學評價方法指南
附錄B  網路藥理學評價要素與評價指標
附錄C  網路藥理學研究報告示例
後記

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