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R語言在基因組分析中的應用

  • 作者：梅步俊
  • 出版社：中國農業科技
  • ISBN：9787511644305
  • 出版日期：2019/11/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：151
人民幣：RMB 58 元      售價：元
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內容大鋼
    本書介紹了生物學數據分析的基本技巧，全書共分5章，內容主要包括：數量遺傳學基礎、統計基因組學中作圖函數和重組率、R語言入門、R語言繪圖、R語言應用於生物統計，包括了基因組分析過程常見的R語言使用技巧等。
作者介紹
梅步俊
目錄
緒論  概率與數理統計簡介
  一、隨機現象和隨機試驗
  二、樣本空間與事件
  三、古典概型
  四、條件概率和事件的獨立性
第一章  數量遺傳學基礎
  第一節  基因頻率和基因型頻率
  第二節  遺傳效應和遺傳差異
  第三節  平均等位基因替代效應
  第四節  遺傳方差組分
  第五節  遺傳力
  第六節  哈代-溫伯格平衡條件下的F2家系
  第七節  模擬基因型分佈
  第八節  哈代一溫伯格比例檢測
第二章  統計基因組學中的作圖函數和重組率
  第一節  Mapping函數與重組
    一、物理圖譜和遺傳圖譜
    二、作圖函數的推導
    三、Haldane作圖函數
    四、Kosambi作圖函數
  第二節  重組率
    一、交配設計
    二、重組率的最大似然估計
    三、標準誤差和顯著性檢驗
    四、估計r期望極大化演算法(EM)
    五、多點方法計算缺失基因型的概率
  第三節  作圖函數的導出
    一、推導必備的積分知識
    二、Haldane作圖函數
    三、Kosambi作圖函數
    四、Haldane作圖函數的另一種推導方式
第三章  R語言入門
  第一節  R語言簡介
    一、R語言的特點
    二、R語言的缺點
    三、重要概念：CRAN
  第二節  應用舉例
  第三節  R語言的數據操作
    一、R語言與工作目錄
    二、改變工作目錄
    三、函數與對象
  第四節  R語言統計學基礎
    一、t檢驗
    二、方差分析
  第五節  導人CSV、TXT文件
    一、read.table函數
    二、scan函數
    三、readxl包
    四、RODBC包(只適用於Windows)
    五、XLConnect包

  第六節  R語言中生成虛擬變數／啞變數
  練習
第四章  R語言繪圖
第五章  R語言應用於生物統計
  一、方差檢驗
  二、多水平多重複數據如何讀取
  三、相關性分析
  四、回歸分析
  五、多元線性回歸分析
  六、變數選擇與最優回歸
  七、Logistic回歸
  練習

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