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基因表達調控系統的定量分析/生物數學叢書

  • 作者：周天壽|總主編:陳蘭蓀
  • 出版社：科學
  • ISBN：9787030608178
  • 出版日期：2019/03/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：282
人民幣：RMB 148 元      售價：元
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內容大鋼
    基因表達調控系統是一類特殊的生物分子調控網路（即一類生化反應網路），是分子系統生物學的主要研究對象。周天壽著的《基因表達調控系統的定量分析/生物數學叢書》從熟知的生物學中心法則出發，深入淺出地、系統而全面地介紹了這類分子網路的建模與分析方法，聚焦于基因表達動力學的定量分析以及有關生物現象的解釋與預測。本書從理論的觀點揭示出基因表達調控系統動力學的本質機制，為深入研究生物分子調控網路和揭示細胞內部過程奠定了理論基礎並提供了方法論基礎。
    本書可供從事數學與生命科學或醫學交叉學科的研究人員（特別是研究生）閱讀和參考。
作者介紹
周天壽|總主編:陳蘭蓀
目錄
《生物數學叢書》序
前言
第1章  基礎知識簡介
  1.1  中心法則
  1.2  生化主方程
    1.2.1  常用形式的主方程
    1.2.2  Chapman-Kolmogorov方程
    1.2.3  求解主方程的通用方法
    1.2.4  Gillespie演算法簡介
  1.3  二項矩方法簡介
    1.3.1  離散主方程及生成函數的微分方程
    1.3.2  二項矩、概率分佈和生成函數之間的關係
    1.3.3  二項矩方程及其截取
    1.3.4  用二項矩計算統計指標
  1.4  分子雜訊源
  1.5  超幾何函數簡介
  1.6  量子力學符號簡介
  參考文獻
第2章  從生滅過程到簡單基因調控網
  2.1  生滅過程
    2.1.1  運動學比率方程
    2.1.2  生化主方程及其分析求解
    2.1.3  兩種近似
  2.2  基因自調控
    2.2.1  確定性模型
    2.2.2  隨機性模型
    2.2.3  雙穩性與雜訊
  2.3  爆髮式表達
    2.3.1  數學模型與分析求解
    2.3.2  轉錄爆發
    2.3.3  翻譯爆發
  2.4  雙基因調控網
    2.4.1  數學模型
    2.4.2  譜方法求解
  參考文獻
第3章  基因表達雜訊及其分解
  3.1  雜訊的通用計算公式
  3.2  簡化的兩狀態基因模型中的雜訊及其分解
  3.3  完整兩狀態基因模型中的雜訊及其分解
  3.4  基因調控模型中的雜訊及其分解
    3.4.1  基因自調控情形
    3.4.2  一般調控情形
  3.5  排隊論意義下基因模型中的內部雜訊
    3.5.1  模型描述
    3.5.2  理論結果：收斂性與重構公式
    3.5.3  矩的計算與雜訊的分析表示
    3.5.4  一個特殊情形分析
  3.6  一般等待時間的基因模型中的統計量分析
    3.6.1  矩生成函數的積分方程
    3.6.2  和已知結果的比較：非馬氏性的效果

  參考文獻
第4章  簡單基因模型中的概率分佈
  4.1  常用基因產物概率分佈的導出
    4.1.1  伽馬分佈
    4.1.2  負二項分佈
    4.1.3  貝塔分佈
  4.2  簡化的兩狀態基因模型中的概率分佈
    4.2.1  靜態概率分佈
    4.2.2  動態概率分佈
  4.3  基因自調控模型中的概率分佈
    4.3.1  反饋情形
    4.3.2  反饋+泄漏情形
  4.4  同時考慮爆發與反饋的基因模型中的概率分佈
  4.5  同時考慮轉錄與翻譯的基因模型中的概率分佈
    4.5.1  構成式表達情形
    4.5.2  爆髮式表達情形
  4.6  考慮外部信號調控的基因模型中的概率分佈
    4.6.1  非線性自調控情形
    4.6.2  靜態外部信號調控情形
    4.6.3  動態外部信號調控情形
  4.7  非協作綁定基因模型中的概率分佈
    4.7.1  模型描述
    4.7.2  模型分析
  參考文獻
第5章  複雜基因調控系統的建模與分析
  5.1  多狀態基因模型中平均on時間和平均off時間
  5.2  多狀態基因模型中表達雜訊的可調性
  5.3  轉錄水平上多狀態基因模型中的概率分佈
  5.4  完整多狀態基因模型中的概率分佈
  5.5  新生RNA運動學的建模與分析
    5.5.1  模型描述
    5.5.2  靜態分佈的形式表示
    5.5.3  靜態矩的形式表示
    5.5.4  特殊情形時的概率分佈
    5.5.5  概率密度函數的不連續性
  參考文獻
第6章  若干重要生物過程的定量效果分析
  6.1  選擇性剪接對基因表達的影響
    6.1.1  模型描述
    6.1.2  基因產物分佈及其特徵
    6.1.3  選擇性剪接對錶達雜訊的影響
  6.2  RNA核駐留對基因表達的影響
    6.2.1  一個簡化但真實的模型及其分析
    6.2.2  扣押模型的構建與分析
    6.2.3  CTN-RNA核駐留對mCAT2基因表達的影響
  6.3  相互作用DNA環對基因表達的影響
    6.3.1  生物背景簡介
    6.3.2  生物假設與數學建模
    6.3.3  分析結果與數值結果
  參考文獻

第7章  基因表達過程的能量代價
  7.1  熵、互信息與能量代價
    7.1.1  概述
    7.1.2  任意生化系統中能量代價的計算
    7.1.3  朗之萬方程系統中能量代價的計算
  7.2  啟動子的能量代價
    7.2.1  能量格式
    7.2.2  幾種特殊情形分析
    7.2.3  某些討論
  7.3  簡單基因調控系統中的能量代價
  7.4  DNA環路相互作用的能量代價
    7.4.1  問題的轉化
    7.4.2  能量代價的計算
  參考文獻
索引
後記
《生物數學叢書》已出版書目

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