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差異表達基因檢測統計方法研究

  • 作者：紀兆華
  • 出版社：北京理工大學
  • ISBN：9787568238403
  • 出版日期：2017/05/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：138
人民幣：RMB 38 元      售價：元
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內容大鋼
    紀兆華著的《差異表達基因檢測統計方法研究》針對差異基因表達樣本表達強度值狀態檢測的特點，研究變點檢測理論應用到差異表達基因檢測的實用化方法，並設計基於變點原理的檢測方法應用於差異表達基因檢測。根據差異表達基因表達值分佈狀態的特點，模擬生成基因表達譜數據陣列，研究基於變點的差異表達基因檢測問題的具體特徵。給出變點的檢測和估計(點估計和區間估計)以及估計量的漸近分佈和收斂速度，最終實現檢測差異表達基因的目的。討論變點檢測方法和R0c接受者操作曲線來研究變點檢測方法的統計性能分析方法和參數優化的方法。通過蒙特卡洛馬爾可夫方法對檢測方法進行驗證，證明基於變點的差異表達基因檢測方法的有效性。把極大似然比檢驗方法、最小二乘法應用到差異表達基因檢測，對基因表達譜模型統計推斷，考慮變點的檢驗或點估計。
作者介紹
紀兆華
目錄
第1章  緒論
  1.1 生物晶元概述
  1.2 基因晶元簡介
    1.2.1 基因晶元的原理
    1.2.2 基因晶元的分類
    1.2.3 基因晶元的應用
  1.3 基因晶元數據差異表達基因檢測統計方法
    1.3.1 差異表達基因檢測概述
    1.3.2 傳統差異表達基因檢測方法
    1.3.3 其他相關的差異表達基因檢測方法
  1.4 變點問題的研究
  1.5 變點理論應用於差異表達基因檢測
  1.6 微陣列基因晶元數據的網路資源介紹
  1.7 本書的研究內容
第2章  差異表達基因檢測樣本子集過表達的統計方法
  2.1 生物學背景
  2.2 差異表達基因檢測統計方法介紹
    2.2.1 基於均值的差異表達基因檢測方法
    2.2.2 基於中值的差異表達基因檢測方法
    2.2.3 基於樣本表達值特定百分比的差異表達基因檢測方法
  2.3 實驗與分析
    2.3.1 ROC曲線比較
    2.3.2 FDR曲線比較
    2.3.3 演算法分析
  2.4 討論
第3章  TriORT差異表達基因檢測統計方法
  3.1 引言
  3.2 TriOTR方法
  3.3 實驗與分析
    3.3.1 模擬研究
    3.3.2 真實數據研究
  3.4 小結
第4章  TriMOST差異表達基因檢測統計方法
  4.1 引言
  4.2 TriMOST方法
  4.3 實驗與分析
    4.3.1 模擬研究
    4.3.2 真實數據研究
  4.4 小結
第5章  差異表達基因檢測統計方法在乳腺癌數據上的應用
  5.1 引言
  5.2 差異表達基因檢測方法
    5.2.1 已有方法介紹
    5.2.2 TriORT方法和TriMOST方法
  5.3 實驗與分析
    5.3.1 ROC曲線模擬實驗
    5.3.2 FDR曲線模擬實驗
    5.3.3 真實數據集實驗
    5.3.4 各方法找到的和乳腺癌相關的基因分析
  5.4 小結

第6章  變點理論統計分析
  6.1 引言
  6.2 基於變點理論的統計方法
    6.2.1 變點
    6.2.2 檢測變點的常用方法
  6.3 變點理論的應用
    6.3.1 變點的統計推斷問題研究
    6.3.2 採用貝葉斯法檢測多個變點的基因表達譜數據
    6.3.3 癌症差異表達基因檢測
  6.4 變點統計分析方法在差異表達基因檢測中的應用
  6.5 小結
第7章  基於樣本子集的差異表達基因檢測方法比較
  7.1 引言
  7.2 差異表達基因檢測方法
    7.2.1 T統計方法
    7.2.2 相對正常組樣本的半T統計方法
    7.2.3 相對癌症組樣本的半T統計方法
    7.2.4 增加參數的半T統計方法
  7.3 實驗和結果分析
    7.3.1 基因表達強度相同時，差異表達基因數目變化
    7.3.2 差異表達基因數目相同時，增加的基因表達強度變化
    7.3.3 基因表達強度相同，差異表達基因數目相同，基因數目不同
    7.3.4 基因表達強度相同，差異表達基因數目相同，基因數目相同時，樣本數目不同
  7.4 小結
第8章  基於變點理論的差異表達基因檢測
  8.1 引言
  8.2 差異表達基因檢測的生物信息學基礎
  8.3 差異表達基因檢測方法
    8.3.1 T檢驗方法
    8.3.2 PPST置換百分比分離測試方法
    8.3.3 LRS基於似然率方法
    8.3.4 基於最小二乘法的變點差異表達基因檢測
  8.4 差異表達基因檢測方法性能評價
  8.5 乳腺癌公共資料庫數據研究分析
  8.6 小結
第9章  總結與展望
  9.1 總結
  9.2 展望
參考文獻

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