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  • 生物信息学中的序列组装方法

  • 所属分类:生物科学>>生物科学>>遗传学、生理学     作者:罗军伟|责编:仓小金     出版社:中国矿大
  •     本书主要包括十章。第1 章主要介绍了序列组装的意 义、难点、步骤和评价,这 些涉及序列组装的基础知识 ,是本书后续内容的基础。 第2章介绍了一种基于insert size分布和双端读数的序列 组装方法,该方法能够有效 的获取更准确的组装结果。 第3章介绍了一种内存低耗 的序列组装方法,该方法能 够在较小的内存空间上完成 整个序列组装过程。第4章 介绍了一种基于双端读数统 计特征的scaffolding方法, 该方法和同类方法相比能够 取得更好的结果。第5章介 绍了一种基于长读数和 contig分类的scaffolding方 法,该方法利用长读数和 contig之间的比对结果,把 contig分成两类,然后分别 进行处理。第6章介绍了一 种gap填充评价方法,该方 法提出了专门针对gap填充 工具的评价指标。第7章介 绍了一种基于读数分割策略 的gap填充方法,该方法对 每个gap区域,确定两个读 数集合,并利用De Bruijn 图填充gap区域。第8章介 绍了一种基于k-mer分布特 征的长读数重叠区检测方法 ,该方法利用两条长读数之 间的共有k-mers,确定其重 叠区域。第9章介绍了一种 基于Hi-C交互矩阵的contig 纠错方法,该方法能够对识 别contig中的一些组装错误 ,并有利用后续的 scaffolding。第10章介绍了 一种基于Hi-C读数的 scaffolding方法,该方法利 用Hi-C比对数据。
  • 人民幣:RMB 38.00 元     售价:NT$ 152.00
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  • 信息遗传学概论(英文版香农信息科学经典)

  • 所属分类:生物科学>>生物科学>>遗传学、生理学     作者:(法)杰拉德·巴特尔|责编:陈亮//夏丹     出版社:世界图书出版公司
  •     遗传可被视为是极长时 间尺度上的基因组信息传递 。然而,基因组会在像人类 生命这样短暂的时间尺度上 产生偶发性错误(即突变) ,并可能导致显著的影响。 香农1948年发表的《通信 的数学原理》开创了信息论 这一新领域,证明了通过一 个不可靠(即可能出现错误 )的信道进行可靠的信息传 输是可能的,但能可靠传递 的信息有一个容量,超过了 这个极限,可靠通信就不再 可能了。近年来随着 Turbocodes等纠错编码的 发明,在电子通信工程中以 接近容量的方式可靠地传输 信息已成为现实。我们日常 生活的很多电子设备(如手 机、CD、DVD、数字电视 等)若没有高效的纠错码是 无法工作的。遗传作为自然 界在长久以前已解决的一个 工程问题,也能用信息论的 角度来研究。DNA的传输容 量很容易以指数形式迅速衰 减,这意味着必须使用纠错 码来再生基因组,才能可靠 地传递遗传信息。假设这样 的纠错编码确实存在,就可 以解释生命世界的基本特征 ,如分立物种及其等级分类 ,连续世代的必需性,甚至 是向复杂生物进化的趋势。 本书有两大目的,一是向遗 传学家展示信息论和纠错编 码是遗传信息传递的必要工 具,还讨论了使用它们的一 些生物学结果,并提出了基 因编码的假设猜测。另一个 目标是促使通信工程师对遗 传学和生物学产生兴趣,以 拓宽他们的视野,超越技术 领域,向最杰出的工程师大 自然学习。
  • 人民幣:RMB 89.00 元     售价:NT$ 356.00
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