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  • 生物信息学中的序列组装方法

  • 所属分类：生物科学>>生物科学>>遗传学、生理学     作者：罗军伟|责编:仓小金     出版社：中国矿大
  •     本书主要包括十章。第1 章主要介绍了序列组装的意 义、难点、步骤和评价，这 些涉及序列组装的基础知识 ，是本书后续内容的基础。 第2章介绍了一种基于insert size分布和双端读数的序列 组装方法，该方法能够有效 的获取更准确的组装结果。 第3章介绍了一种内存低耗 的序列组装方法，该方法能 够在较小的内存空间上完成 整个序列组装过程。第4章 介绍了一种基于双端读数统 计特征的scaffolding方法， 该方法和同类方法相比能够 取得更好的结果。第5章介 绍了一种基于长读数和 contig分类的scaffolding方 法，该方法利用长读数和 contig之间的比对结果，把 contig分成两类，然后分别 进行处理。第6章介绍了一 种gap填充评价方法，该方 法提出了专门针对gap填充 工具的评价指标。第7章介 绍了一种基于读数分割策略 的gap填充方法，该方法对 每个gap区域，确定两个读 数集合，并利用De Bruijn 图填充gap区域。第8章介 绍了一种基于k-mer分布特 征的长读数重叠区检测方法 ，该方法利用两条长读数之 间的共有k-mers，确定其重 叠区域。第9章介绍了一种 基于Hi-C交互矩阵的contig 纠错方法，该方法能够对识 别contig中的一些组装错误 ，并有利用后续的 scaffolding。第10章介绍了 一种基于Hi-C读数的 scaffolding方法，该方法利 用Hi-C比对数据。
  • 人民币：RMB 38.00 元     售价：NT$ 152.00 元
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