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基於蛋白質相互作用網路的演算法研究及其應用

作者：湯希瑋
出版社：科學
ISBN：9787030585714

出版日期：2018/08/01
裝幀：平裝
頁數：204

人民幣：RMB 98 元售價：元

內容大鋼

為了揭示蛋白質網路的動態特徵，酵母的時間序列基因表達譜被用於分離靜態的蛋白質網路，進而構建隨時間變化的動態蛋白質網路。為了理解蛋白質的關鍵性和聚集性，基因表達譜和亞細胞位置信息被引入蛋白質相互作用網路中，從而設計了一系列蛋白質複合物挖掘演算法和關鍵蛋白質識別演算法，並對新提出的演算法進行了詳細的、多角度的比較測試。考慮到蛋白質網路在疾病基因識別過程中所起的巨大作用，本書的後半部分，從蛋白質網路出發，重點研究了各種疾病基因與蛋白質網路的關係，提出了一系列與腫瘤等複雜疾病有關的基因識別演算法。最後，集中探討了蛋白質網路研究的新方向。
湯希瑋著的《基於蛋白質相互作用網路的演算法研究及其應用》適合電腦科學、生物信息學、生物醫學研究人員和教師閱讀使用，也可作為相關專業本科生和研究生的學習參考材料。

作者介紹

湯希瑋

前言
第1章  緒論
  1.1  蛋白質網路的計算分析
    1.1.1  蛋白質網路及其研究所面臨的挑戰
    1.1.2  蛋白質網路研究的具體內容
  1.2  蛋白質網路在疾病研究中的應用
    1.2.1  過濾方法
    1.2.2  文本和數據挖掘方法
    l.2.3  基於網路的方法
  1.3  本書的主要研究內容和框架
    1.3.1  分離靜態蛋白質網路為不同時刻的動態網路
    1.3.2  關鍵蛋白質偵測演算法
    1.3.3  蛋白質複合物挖掘演算法
    1.3.4  疾病基岡識別演算法
  1.4  本書的結構
  1.5  本章總結
第2章  動態蛋白質網路研究
  2.1  研究背景
  2.2  動態蛋白質網路構建方法
    2.2.1  數據集
    2.2.2  重構TDPINs
    2.2.3  從TC—PINs中識別蛋白質複合物
    2.2.4  評價指標
  2.3  結果和討論
  2.4  本章總結
第3章  關鍵蛋白質研究
  3.1  研究背景
  3.2  關鍵蛋白質偵測演算法wDc
    3.2.1  演算法描述
    3.2.2  結果和討論
  3.3  關鍵蛋白質偵測演算法CNC
    3.3.1  演算法描述
    3.3.2  結果和討論
  3.4  關鍵蛋白質偵測演算法SCP
    3.4.1  演算法描述
    3.4.2  結果和討論
  3.5  本章總結
第4章  蛋白質複合物研究
  4.1  研究背景
  4.2  蛋白質複合物挖掘演算法CMBI
    4.2.1  演算法描述
    4.2.2  結果和討論
  4.3  蛋白質複合物挖掘演算法ClusterBFS
    4.3.1  演算法描述
    4.3.2  結果和討論
  4.4  本章總結
第5章  基於蛋白質網路的疾病基因研究
  5.1  研究背景
  5.2  疾病基因識別演算法PDMG
    5.2.1  演算法描述

    5.2.2  結果和討論
  5.3  疾病基因識別演算法IMIDG
    5.3.1  演算法描述
    5.3.2  結果和討論
  5.4  本章總結
第6章  結束語
  6.1  本書的主要貢獻和創新點
  6.2  展望
參考文獻
後記
彩圖

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