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腫瘤標誌物的計算識別與分析

作者：曹忠波//杜偉//梁艷春
出版社：科學
ISBN：9787030594372

出版日期：2018/11/01
裝幀：平裝
頁數：115

人民幣：RMB 88 元售價：元

內容大鋼

曹忠波、杜偉、梁艷春著的《腫瘤標誌物的計算識別與分析》主要針對基於表達數據的腫瘤標誌物的計算識別與分析方法進行系統的研究，分別對基因表達數據和miRNA表達數據兩方面內容進行分析。本書提出基於過濾方法的改進的特徵選擇演算法，並應用於成對的基因表達數據分析中，再對演算法的有效性與穩定性等方面進行全面的評估。本書還對基於表達數據的miRNA腫瘤標誌物進行綜合的計算識別與分析，包括對單一癌症類型的特異miRNA標誌物和多種癌症類型間共同的miRNA標誌物的識別，為進一步的生物學、醫學實驗分析提供潛在的候選標誌物集合。
本書可作為生物信息學、腫瘤生物信息學等相關專業的高年級本科生或研究生以及相關研究領域生命科學、醫學工作者和電腦應用人員的參考用書。

作者介紹

曹忠波//杜偉//梁艷春

前言
第1章  緒論
  1.1  生物信息學
  1.2  癌症及標誌物簡介
  l.3  腫瘤標誌物研究現狀
第2章  基因晶元基礎
  2.1  基因晶元概述
    2.1.1  基因晶元原理
    2.1.2  晶元表達數據分析概要
  2.2  基因晶元數據的收集
  2.3  基因晶元數據預處理
    2.3.1  數據去噪
    2.3.2  空值填充策略
  2.31  3數據轉換與標準化
  2.4  基因晶元數據分析的研究背景及現狀
第3章  癌症表達數據資源及預處理方法
  3.1  癌症表達數據來源與處理簡介
    3.1.1  癌症表達數據的來源
    3.1.2  表達數據的矩陣表示及相關處理
  3.2  特徵選擇技術簡介
    3.2.1  特徵選擇方法介紹
    3.2.2  特徵選擇演算法在生物信息學中的應用
  3.3  常用的差異表達基因識別方法
    3.3.1  t—test方法
    3.3.2  倍數變化法
第4章  改進的過濾特徵選擇演算法在基因表達數據分析中的應用
  4.1  本章概要
  4.2  基因晶元的特徵選擇方法研究背景
  4.3  研究方法
    4.3.1  數據來源
    4.3.2  數據預處理
    4.3.3  改進的成對t—test方法
    4.3.4  統計顯著性評估
    4.3.5  冗余基因識別
    4.3.6  性能評估
  4.4  實驗結果
    4.4.1  分類準確率評估結果
    4.4.2  特徵基因的穩定性評估結果
    4.4.3  功能穩定性評估結果
    4.4.4  功能富集分析評估結果
    4.4.5  結果的生物學分析
  4.5  本章小結
第5章  miRNA腫瘤標誌物的識別與分析
  5.1  本章概要
  5.2  miRNA標誌物研究背景
  5.3  數據來源
    5.3.1  成對的miRNA表達數據
    5.3.2  循環miRNA信息
  5.4  研究方法
    5.4.1  每種癌症中差異表達的miRNA的識別

    5.4.2  單數據集上特異miRNA標誌物的識別
    5.4.3  多種癌症間共同的差異表達的miRNA識別
    5.4.4  特定癌症類型的組合miRNA標誌物識別
    5.4.5  差異表達的miRNA靶基因pathway富集分析
    5.4.6  評估過程
  5.5  實驗結果
    5.5.1  每種癌症類型差異表達miRNA的識別與分析
    5.5.2  多種癌症類型早期階段的共同標誌物識別與分析
  5.6  本章小結
參考文獻

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