幫助中心 | 我的帳號 | 關於我們
進階搜尋
car

同類熱銷排行榜

最近瀏覽的商品

RNA-seq數據分析實用方法/新生物學叢書

  • 作者：編者:(芬)E.科佩萊恩//J.圖梅拉//P.薩默沃//(瑞典)M.赫斯//(芬)G.旺|譯者:陳建國//張海謀
  • 出版社：科學
  • ISBN：9787030564863
  • 出版日期：2018/03/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：230
人民幣：RMB 120 元      售價：元
放入購物車
加入收藏夾
內容大鋼
    E.科佩萊恩、J.圖梅拉、P.薩默沃、M.赫斯、G.旺編著的《RNA-seq數據分析實用方法》全面介紹了RNA-seq數據分析的基本原理和方法，內容涵蓋數據分析的整個工作流程，包括質量控制、作圖、組裝、統計檢驗和代謝途徑分析等。書中在進行理論講解的同時，還使用了較多實例，不僅生物信息學家，甚至沒有相關分析經驗的研究人員也均可參照這些實例進行分析。
    本書是一部RNA-seq數據分析的實用參考書，可供生物學、醫學、遺傳學和電腦科學領域的研究人員閱讀，也可作為相關專業的高年級本科生課程、研究生課程，以及短期培訓班的教材。
作者介紹
編者:(芬)E.科佩萊恩//J.圖梅拉//P.薩默沃//(瑞典)M.赫斯//(芬)G.旺|譯者:陳建國//張海謀
目錄
第1章  RNA-seq簡介
  1.1 引言
  1.2 RNA的分離
  1.3 RNA的質量控制
  1.4 文庫製備
  1.5 主要的RNA-seq平台
    1.5.1 Illumina
    1.5.2 SOLID
    1.5.3 Roche 454
    1.5.4 Ion Torrent
    1.5.5 Pacific Bioscience
    1.5.6 納米孔技術
  1.6 RNA-seq的應用
    1.6.1 蛋白質編碼基因結構
    1.6.2 新型蛋白質編碼基因
    1.6.3 基因表達的量化和比較
    1.6.4 表達數量性狀基因座
    1.6.5 單細胞RNA-seq
    1.6.6 融合基因
    1.6.7 基因變異
    1.6.8 長的非編碼RNA
    1.6.9 非編碼小RNA
    1.6.10 擴增產物測序（ampli-seq）
  1.7 選擇RNA-seq平台
    1.7.1 選擇RNA-seq平台和測序模式的8個原則
    1.7.2 小結
  參考文獻
第2章  RNA-seq數據分析導論
  2.1 引言
  2.2 差異表達分析工作流程
    2.2.1 第一步：讀段的質量控制
    2.2.2 第二步：讀段的預處理
    2.2.3 第三步：將讀段比對到參考基因組
    2.2.4 第四步：基因組引導的轉錄組組裝
    2.2.5 第五步：計算表達水平
    2.2.6 第六步：比較不同條件之間的基因表達
    2.2.7 第七步：在基因組的上下文中的數據可視化
  2.3 下游分析
    2.3.1 基因註釋
    2.3.2 基因集的富集分析
  2.4 自動的工作流程和管線
  2.5 硬體要求
  2.6 仿效書中的示例
    2.6.1 使用命令行工具和R
    2.6.2 使用Chipster軟體
    2.6.3 示例數據集
  2.7 小結
  參考文獻
第3章  質量控制和預處理
  3.1 引言

  3.2 質量控制和預處理的軟體
    3.2.1 FastQC
    3.2.2 PRINSEQ
    3.2.3 Trimmomatic
  3.3 讀段質量問題
    3.3.1 鹼基質量
    3.3.2 模糊的鹼基
    3.3.3 接頭
    3.3.4 讀段長度
    3.3.5 序列特異性偏差和由隨機聯體引物造成的不匹配
    3.3.6 GC含量
    3.3.7 重複
  ……
第4章  將讀段比對到參考基因組
第5章  轉錄組組裝
第6章  定量和基於註釋的質量控制
第7章  R和Bioconductor中的RNA-seq分析框架
第8章  差異表達分析
第9章  差異外顯子用法分析
第10章  註釋結果
第11章  可視化
第12章  非編碼小RNA
第13章  非編碼小RNA測序數據的分析

  • 商品搜索：
  • | 高級搜索
首頁│ 新手上路│ 客服中心│ 關於我們│ 聯絡我們│ Top↑│
Copyrightc 1999~2008 美商天龍國際圖書股份有限公司 臺灣分公司. All rights reserved.
營業地址:臺北市中正區重慶南路一段103號1F 105號1F-2F
讀者服務部電話：02-2381-2033 02-2381-1863　時間：週一-週五 10:00-17:00
　服務信箱：bookuu@69book.com 客戶、意見信箱:cs@69book.com
ICP證：浙B2-20060032