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實用生物信息學/生命科學與信息技術叢書

  • 作者：馮世鵬//湯華//周犀//周智
  • 出版社：電子工業
  • ISBN：9787121302244
  • 出版日期：2017/08/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：330
人民幣：RMB 69 元      售價：元
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內容大鋼
    生物信息學是生命科學領域中的一門新興的前沿科學，其發展在很大程度上改變了人們研究利用生物的方式方法，成為生命科學研究最重要的工具之一。馮世鵬、湯華、周犀、周智著的《實用生物信息學》由Windows篇和Linux篇兩部分組成，重點闡述生物信息學的基本概念與相關技術。Windows篇討論了在Windows操作系統下進行資料庫檢索、引物設計、核酸蛋白質序列轉換、物種進化樹構建、蛋白質高級結構預測分析、非編碼miRNA研究應用等理論與方法，以及給出相關軟體的使用介紹。Linux篇討論了在Linux操作系統下進行基因組測序，RNA-seq、miRNA-seq等測序數據質控，基因組組裝，轉錄組分析，基因預測、註釋，基因表達分析等操作訓練，並且給出對應軟體的使用介紹。
    本書的特色是緊貼科研實踐、圖文並茂、內容深淺合適、可操作性強、實用性高，讀者可根據書中的步驟輕鬆實現相應分析，可供從事生物學、農學、醫學的科技工作者、教師、學生作為生物信息學入門的參考書籍。
作者介紹
馮世鵬//湯華//周犀//周智
目錄
第0章 緒論
  0.1 生物信息學的發展歷史
    0.1.1 Bioinfomatics的來源
    0.1.2 生物信息學的定義
    0.1.3 人類基因組計劃
    0.1.4 生物信息學發展重要人物及
    大事
  0.2 生物信息學的研究內容
    0.2.1 生物分子數據的收集與管理
    0.2.2 資料庫搜索及序列比較
    0.2.3 基因組序列分析
    0.2.4 基因表達數據的分析與處理
    0.2.5 蛋白質結構預測
    0.2.6 非編碼RNA研究
    0.2.7 表觀遺傳學研究
  0.3 生物信息學的生物學基礎知識
    0.3.1 遺傳定律
    0.3.2 DNA分子結構
    0.3.3 基因結構
    0.3.4 中心法則
    0.3.5 密碼子表
    0.3.6 蛋白質結構與功能
    0.3.7 PCR技術
  參考文獻
Windows篇
  第1章 文獻信息檢索
    1.1 文獻資源的分類
    1.1.1 根據出版形式進行分類
    1.1.2 綜合分類法
    1.1.3 標識碼及編號
    1.2 文獻的格式
    1.3 文獻檢索
    1.3.1 文獻檢索詞的來源
    1.3.2 搜索資料庫選擇
    1.3.3 檢索式構建
    1.3.4 檢索結果的處理
    1.3.5 CNKI資料庫查詢舉例
    1.3.6 Elsevier資料庫檢索舉例
    1.4 文獻信息的價值判斷及閱讀
    1.4.1 文獻的價值判斷
    1.4.2 文獻有效閱讀
    1.5 科技查新
    習題
    參考文獻
  第2章 生物信息數據資源
    2.1 核酸序列資料庫
    2.1.1 GenBank資料庫及其分類
    2.1.2 Entrz Nucleotide資料庫及其分類
    2.1.3 NCBI其他資料庫
    2.1.4 GenBank數據格式

    2.1.5 GenBank數據訪問方式
    2.1.6 基因資料庫記錄格式及搜索
    2.2 蛋白質序列資料庫
    2.2.1 UniProt資料庫介紹
    2.2.2 Uniprot數據獲得方式
    2.2.3 UniProt資料庫記錄格式
    2.3 蛋白質結構資料庫
    2.3.1 PDB資料庫發展歷史
    2.3.2 RCSB PDB資料庫介紹
    2.3.3 RCSB PDB資料庫搜索
    2.3.4 RCSB PDB數據記錄
    2.4 物種基因組資料庫
    2.4.1 小鼠基因組資料庫
    2.4.2 擬南芥基因組資料庫
    2.5 代謝通路資料庫
    2.5.1 在KEGG資料庫搜索
    2.5.2 主頁快速鏈接
    2.5.3 KEGG通路圖及其元素意義
    2.6 基因組瀏覽器
    2.6.1 基因組數據展示內容
    2.6.2 BLAT搜索
    2.7 非編碼RNA資料庫
    2.7.1 miRNA資料庫
    2.7.2 NONCODE資料庫
    習題
    參考文獻
  第3章 序列比對
  第4章 核酸序列分析
  第5章 蛋白質序列分析
  第6章 基因表達分析
  第7章 進化分析
  第8章 非編碼miRNA分析
Linux篇
  第9章 Linux系統
  第10章 Perl語言
  第11章 測序方法及數據處理
  第12章 基因組組裝
  第13章 小RNA測序數據分析
  第14章 RNA-seq數據分析
  第15章 基因預測
  第16章 基因註釋及功能分析
附錄A 生物信息學文件格式

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